Protein–RNA interactions for Protein: O88983

Stx8, Syntaxin-8, mousemouse

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx8O88983 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Stx8O88983 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Stx8O88983 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Stx8O88983 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Stx8O88983 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Stx8O88983 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Stx8O88983 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Stx8O88983 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Stx8O88983 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Stx8O88983 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Stx8O88983 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Stx8O88983 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Stx8O88983 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Stx8O88983 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Stx8O88983 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Stx8O88983 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Stx8O88983 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Stx8O88983 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Stx8O88983 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Stx8O88983 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Stx8O88983 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Stx8O88983 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Stx8O88983 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Stx8O88983 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Stx8O88983 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Stx8O88983 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Stx8O88983 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Stx8O88983 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Stx8O88983 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Stx8O88983 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Stx8O88983 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Stx8O88983 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Stx8O88983 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Stx8O88983 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Stx8O88983 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Stx8O88983 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Stx8O88983 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Stx8O88983 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Stx8O88983 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Stx8O88983 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Stx8O88983 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Stx8O88983 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Stx8O88983 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Stx8O88983 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Stx8O88983 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Stx8O88983 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Stx8O88983 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Stx8O88983 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Stx8O88983 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Stx8O88983 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Stx8O88983 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Stx8O88983 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Stx8O88983 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Stx8O88983 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Stx8O88983 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Stx8O88983 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Stx8O88983 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Stx8O88983 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC26.08■■□□□ 1.76
Stx8O88983 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Stx8O88983 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Stx8O88983 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Stx8O88983 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Stx8O88983 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Stx8O88983 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Stx8O88983 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Stx8O88983 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Stx8O88983 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Stx8O88983 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Stx8O88983 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Stx8O88983 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Stx8O88983 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Stx8O88983 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Stx8O88983 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Stx8O88983 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Stx8O88983 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Stx8O88983 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Stx8O88983 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Stx8O88983 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Stx8O88983 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Stx8O88983 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Stx8O88983 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Stx8O88983 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Stx8O88983 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Stx8O88983 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Stx8O88983 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Stx8O88983 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Stx8O88983 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Stx8O88983 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Stx8O88983 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Stx8O88983 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Stx8O88983 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Stx8O88983 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Stx8O88983 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Stx8O88983 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Stx8O88983 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Stx8O88983 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Stx8O88983 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Stx8O88983 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Stx8O88983 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Stx8O88983 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.7 ms