Protein–RNA interactions for Protein: O88940

Msc, Musculin, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MscO88940 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MscO88940 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MscO88940 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
MscO88940 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
MscO88940 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MscO88940 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MscO88940 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MscO88940 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MscO88940 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MscO88940 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MscO88940 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MscO88940 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MscO88940 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MscO88940 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MscO88940 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MscO88940 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
MscO88940 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MscO88940 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MscO88940 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MscO88940 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MscO88940 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MscO88940 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MscO88940 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MscO88940 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MscO88940 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MscO88940 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MscO88940 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MscO88940 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MscO88940 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MscO88940 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MscO88940 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MscO88940 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MscO88940 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MscO88940 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MscO88940 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MscO88940 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MscO88940 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MscO88940 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MscO88940 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MscO88940 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MscO88940 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MscO88940 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MscO88940 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MscO88940 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MscO88940 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MscO88940 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MscO88940 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
MscO88940 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
MscO88940 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
MscO88940 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
MscO88940 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
MscO88940 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MscO88940 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MscO88940 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MscO88940 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MscO88940 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MscO88940 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
MscO88940 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MscO88940 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MscO88940 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MscO88940 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MscO88940 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MscO88940 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
MscO88940 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MscO88940 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MscO88940 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MscO88940 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MscO88940 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MscO88940 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MscO88940 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MscO88940 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MscO88940 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
MscO88940 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MscO88940 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MscO88940 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
MscO88940 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MscO88940 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
MscO88940 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
MscO88940 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MscO88940 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MscO88940 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MscO88940 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
MscO88940 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MscO88940 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MscO88940 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MscO88940 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MscO88940 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MscO88940 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
MscO88940 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
MscO88940 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MscO88940 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
MscO88940 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MscO88940 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MscO88940 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MscO88940 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MscO88940 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MscO88940 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MscO88940 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MscO88940 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MscO88940 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.9 ms