Protein–RNA interactions for Protein: O88554

Parp2, Poly [ADP-ribose] polymerase 2, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp2O88554 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Parp2O88554 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Parp2O88554 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Parp2O88554 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Parp2O88554 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Parp2O88554 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Parp2O88554 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Parp2O88554 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Parp2O88554 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Parp2O88554 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Parp2O88554 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Parp2O88554 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Parp2O88554 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Parp2O88554 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Parp2O88554 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Parp2O88554 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Parp2O88554 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Parp2O88554 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Parp2O88554 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Parp2O88554 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Parp2O88554 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Parp2O88554 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Parp2O88554 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Parp2O88554 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Parp2O88554 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Parp2O88554 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Parp2O88554 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Parp2O88554 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Parp2O88554 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Parp2O88554 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Parp2O88554 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Parp2O88554 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Parp2O88554 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Parp2O88554 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Parp2O88554 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Parp2O88554 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Parp2O88554 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Parp2O88554 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Parp2O88554 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Parp2O88554 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Parp2O88554 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Parp2O88554 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Parp2O88554 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Parp2O88554 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Parp2O88554 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Parp2O88554 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Parp2O88554 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Parp2O88554 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Parp2O88554 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Parp2O88554 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Parp2O88554 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Parp2O88554 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Parp2O88554 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Parp2O88554 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Parp2O88554 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Parp2O88554 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Parp2O88554 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Parp2O88554 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Parp2O88554 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Parp2O88554 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Parp2O88554 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Parp2O88554 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Parp2O88554 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Parp2O88554 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Parp2O88554 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Parp2O88554 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Parp2O88554 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Parp2O88554 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Parp2O88554 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Parp2O88554 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Parp2O88554 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Parp2O88554 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Parp2O88554 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Parp2O88554 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Parp2O88554 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Parp2O88554 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Parp2O88554 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Parp2O88554 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Parp2O88554 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Parp2O88554 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Parp2O88554 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Parp2O88554 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Parp2O88554 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Parp2O88554 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Parp2O88554 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Parp2O88554 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Parp2O88554 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Parp2O88554 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Parp2O88554 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Parp2O88554 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Parp2O88554 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Parp2O88554 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Parp2O88554 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Parp2O88554 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Parp2O88554 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Parp2O88554 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Parp2O88554 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Parp2O88554 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Parp2O88554 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Parp2O88554 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.2 ms