Protein–RNA interactions for Protein: O88543

Cops3, COP9 signalosome complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops3O88543 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cops3O88543 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cops3O88543 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cops3O88543 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cops3O88543 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cops3O88543 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cops3O88543 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cops3O88543 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cops3O88543 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cops3O88543 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cops3O88543 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cops3O88543 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cops3O88543 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cops3O88543 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cops3O88543 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cops3O88543 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cops3O88543 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cops3O88543 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cops3O88543 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cops3O88543 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cops3O88543 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cops3O88543 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cops3O88543 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cops3O88543 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cops3O88543 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cops3O88543 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cops3O88543 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cops3O88543 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cops3O88543 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cops3O88543 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cops3O88543 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cops3O88543 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Cops3O88543 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cops3O88543 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cops3O88543 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cops3O88543 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cops3O88543 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cops3O88543 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cops3O88543 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cops3O88543 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cops3O88543 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Cops3O88543 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cops3O88543 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cops3O88543 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cops3O88543 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cops3O88543 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cops3O88543 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cops3O88543 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cops3O88543 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cops3O88543 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cops3O88543 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cops3O88543 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cops3O88543 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cops3O88543 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cops3O88543 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cops3O88543 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cops3O88543 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cops3O88543 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cops3O88543 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cops3O88543 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cops3O88543 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cops3O88543 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cops3O88543 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cops3O88543 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cops3O88543 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cops3O88543 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cops3O88543 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cops3O88543 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cops3O88543 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cops3O88543 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cops3O88543 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cops3O88543 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cops3O88543 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cops3O88543 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cops3O88543 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cops3O88543 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cops3O88543 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cops3O88543 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cops3O88543 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cops3O88543 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cops3O88543 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Cops3O88543 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cops3O88543 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cops3O88543 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cops3O88543 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cops3O88543 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cops3O88543 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cops3O88543 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cops3O88543 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cops3O88543 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cops3O88543 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cops3O88543 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cops3O88543 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cops3O88543 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cops3O88543 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cops3O88543 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cops3O88543 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cops3O88543 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cops3O88543 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cops3O88543 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms