Protein–RNA interactions for Protein: O88516

Dll3, Delta-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dll3O88516 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dll3O88516 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dll3O88516 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Dll3O88516 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Dll3O88516 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Dll3O88516 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Dll3O88516 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Dll3O88516 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Dll3O88516 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Dll3O88516 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Dll3O88516 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Dll3O88516 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Dll3O88516 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Dll3O88516 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Dll3O88516 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Dll3O88516 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Dll3O88516 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Dll3O88516 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Dll3O88516 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Dll3O88516 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Dll3O88516 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Dll3O88516 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Dll3O88516 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Dll3O88516 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Dll3O88516 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Dll3O88516 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Dll3O88516 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Dll3O88516 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Dll3O88516 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Dll3O88516 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Dll3O88516 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Dll3O88516 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Dll3O88516 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Dll3O88516 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Dll3O88516 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Dll3O88516 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Dll3O88516 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Dll3O88516 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Dll3O88516 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Dll3O88516 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Dll3O88516 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Dll3O88516 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Dll3O88516 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Dll3O88516 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Dll3O88516 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Dll3O88516 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Dll3O88516 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Dll3O88516 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Dll3O88516 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Dll3O88516 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Dll3O88516 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Dll3O88516 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Dll3O88516 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Dll3O88516 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Dll3O88516 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Dll3O88516 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Dll3O88516 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Dll3O88516 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Dll3O88516 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Dll3O88516 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Dll3O88516 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Dll3O88516 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Dll3O88516 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Dll3O88516 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Dll3O88516 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Dll3O88516 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Dll3O88516 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Dll3O88516 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Dll3O88516 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Dll3O88516 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Dll3O88516 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Dll3O88516 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Dll3O88516 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Dll3O88516 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Dll3O88516 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Dll3O88516 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Dll3O88516 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Dll3O88516 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Dll3O88516 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Dll3O88516 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Dll3O88516 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Dll3O88516 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Dll3O88516 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Dll3O88516 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Dll3O88516 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Dll3O88516 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Dll3O88516 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Dll3O88516 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Dll3O88516 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Dll3O88516 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Dll3O88516 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Dll3O88516 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Dll3O88516 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Dll3O88516 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Dll3O88516 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Dll3O88516 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Dll3O88516 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Dll3O88516 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Dll3O88516 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Dll3O88516 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms