Protein–RNA interactions for Protein: O88351

Ikbkb, Inhibitor of nuclear factor kappa-B kinase subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 757 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IkbkbO88351 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
IkbkbO88351 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
IkbkbO88351 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
IkbkbO88351 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
IkbkbO88351 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
IkbkbO88351 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
IkbkbO88351 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
IkbkbO88351 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
IkbkbO88351 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
IkbkbO88351 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
IkbkbO88351 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
IkbkbO88351 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
IkbkbO88351 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
IkbkbO88351 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
IkbkbO88351 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
IkbkbO88351 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
IkbkbO88351 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
IkbkbO88351 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
IkbkbO88351 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
IkbkbO88351 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
IkbkbO88351 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
IkbkbO88351 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
IkbkbO88351 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
IkbkbO88351 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
IkbkbO88351 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
IkbkbO88351 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
IkbkbO88351 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
IkbkbO88351 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
IkbkbO88351 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
IkbkbO88351 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
IkbkbO88351 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
IkbkbO88351 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
IkbkbO88351 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
IkbkbO88351 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
IkbkbO88351 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
IkbkbO88351 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
IkbkbO88351 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
IkbkbO88351 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
IkbkbO88351 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
IkbkbO88351 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
IkbkbO88351 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
IkbkbO88351 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
IkbkbO88351 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
IkbkbO88351 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
IkbkbO88351 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
IkbkbO88351 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
IkbkbO88351 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
IkbkbO88351 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
IkbkbO88351 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
IkbkbO88351 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
IkbkbO88351 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
IkbkbO88351 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
IkbkbO88351 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
IkbkbO88351 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
IkbkbO88351 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
IkbkbO88351 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
IkbkbO88351 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
IkbkbO88351 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
IkbkbO88351 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
IkbkbO88351 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
IkbkbO88351 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
IkbkbO88351 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
IkbkbO88351 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
IkbkbO88351 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
IkbkbO88351 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
IkbkbO88351 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
IkbkbO88351 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
IkbkbO88351 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
IkbkbO88351 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
IkbkbO88351 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
IkbkbO88351 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
IkbkbO88351 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
IkbkbO88351 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
IkbkbO88351 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
IkbkbO88351 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
IkbkbO88351 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
IkbkbO88351 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
IkbkbO88351 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
IkbkbO88351 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
IkbkbO88351 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
IkbkbO88351 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
IkbkbO88351 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
IkbkbO88351 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
IkbkbO88351 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
IkbkbO88351 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
IkbkbO88351 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
IkbkbO88351 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
IkbkbO88351 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
IkbkbO88351 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
IkbkbO88351 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
IkbkbO88351 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
IkbkbO88351 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
IkbkbO88351 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
IkbkbO88351 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
IkbkbO88351 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
IkbkbO88351 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
IkbkbO88351 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
IkbkbO88351 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
IkbkbO88351 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
IkbkbO88351 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.7 ms