Protein–RNA interactions for Protein: O70456

Sfn, 14-3-3 protein sigma, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SfnO70456 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SfnO70456 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SfnO70456 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SfnO70456 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SfnO70456 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SfnO70456 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SfnO70456 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SfnO70456 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SfnO70456 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SfnO70456 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SfnO70456 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SfnO70456 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SfnO70456 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SfnO70456 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SfnO70456 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SfnO70456 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SfnO70456 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SfnO70456 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SfnO70456 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SfnO70456 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SfnO70456 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SfnO70456 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SfnO70456 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SfnO70456 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SfnO70456 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SfnO70456 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SfnO70456 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SfnO70456 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SfnO70456 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SfnO70456 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SfnO70456 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SfnO70456 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SfnO70456 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SfnO70456 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SfnO70456 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SfnO70456 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SfnO70456 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SfnO70456 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SfnO70456 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SfnO70456 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SfnO70456 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SfnO70456 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SfnO70456 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SfnO70456 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SfnO70456 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SfnO70456 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SfnO70456 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SfnO70456 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SfnO70456 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SfnO70456 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SfnO70456 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SfnO70456 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SfnO70456 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SfnO70456 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SfnO70456 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SfnO70456 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SfnO70456 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SfnO70456 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SfnO70456 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SfnO70456 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SfnO70456 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SfnO70456 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SfnO70456 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SfnO70456 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SfnO70456 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SfnO70456 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SfnO70456 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SfnO70456 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SfnO70456 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SfnO70456 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SfnO70456 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SfnO70456 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SfnO70456 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SfnO70456 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SfnO70456 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SfnO70456 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SfnO70456 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SfnO70456 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SfnO70456 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SfnO70456 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SfnO70456 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SfnO70456 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SfnO70456 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SfnO70456 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SfnO70456 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SfnO70456 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SfnO70456 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SfnO70456 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SfnO70456 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SfnO70456 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SfnO70456 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SfnO70456 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SfnO70456 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SfnO70456 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SfnO70456 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SfnO70456 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SfnO70456 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SfnO70456 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SfnO70456 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SfnO70456 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms