Protein–RNA interactions for Protein: O70373

Xirp1, Xin actin-binding repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xirp1O70373 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Xirp1O70373 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Xirp1O70373 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Xirp1O70373 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Xirp1O70373 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Xirp1O70373 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Xirp1O70373 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Xirp1O70373 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Xirp1O70373 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Xirp1O70373 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Xirp1O70373 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Xirp1O70373 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Xirp1O70373 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Xirp1O70373 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Xirp1O70373 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Xirp1O70373 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Xirp1O70373 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Xirp1O70373 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Xirp1O70373 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Xirp1O70373 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Xirp1O70373 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Xirp1O70373 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Xirp1O70373 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Xirp1O70373 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Xirp1O70373 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Xirp1O70373 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Xirp1O70373 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Xirp1O70373 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Xirp1O70373 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Xirp1O70373 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Xirp1O70373 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Xirp1O70373 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Xirp1O70373 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Xirp1O70373 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Xirp1O70373 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Xirp1O70373 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Xirp1O70373 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Xirp1O70373 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Xirp1O70373 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Xirp1O70373 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Xirp1O70373 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Xirp1O70373 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Xirp1O70373 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Xirp1O70373 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Xirp1O70373 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Xirp1O70373 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Xirp1O70373 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Xirp1O70373 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Xirp1O70373 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Xirp1O70373 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Xirp1O70373 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Xirp1O70373 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Xirp1O70373 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Xirp1O70373 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Xirp1O70373 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Xirp1O70373 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Xirp1O70373 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Xirp1O70373 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Xirp1O70373 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
Xirp1O70373 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Xirp1O70373 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Xirp1O70373 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Xirp1O70373 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Xirp1O70373 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Xirp1O70373 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Xirp1O70373 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Xirp1O70373 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Xirp1O70373 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Xirp1O70373 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Xirp1O70373 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Xirp1O70373 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Xirp1O70373 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Xirp1O70373 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Xirp1O70373 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Xirp1O70373 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Xirp1O70373 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Xirp1O70373 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Xirp1O70373 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Xirp1O70373 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Xirp1O70373 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Xirp1O70373 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Xirp1O70373 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Xirp1O70373 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Xirp1O70373 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Xirp1O70373 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Xirp1O70373 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Xirp1O70373 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Xirp1O70373 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Xirp1O70373 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Xirp1O70373 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Xirp1O70373 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Xirp1O70373 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Xirp1O70373 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Xirp1O70373 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Xirp1O70373 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Xirp1O70373 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Xirp1O70373 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Xirp1O70373 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Xirp1O70373 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Xirp1O70373 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 123.9 ms