Protein–RNA interactions for Protein: O70340

Nptx2, Neuronal pentraxin-2, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nptx2O70340 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nptx2O70340 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nptx2O70340 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nptx2O70340 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nptx2O70340 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nptx2O70340 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nptx2O70340 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nptx2O70340 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nptx2O70340 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nptx2O70340 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nptx2O70340 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nptx2O70340 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nptx2O70340 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nptx2O70340 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nptx2O70340 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nptx2O70340 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Nptx2O70340 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nptx2O70340 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nptx2O70340 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nptx2O70340 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nptx2O70340 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nptx2O70340 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nptx2O70340 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Nptx2O70340 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nptx2O70340 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nptx2O70340 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nptx2O70340 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nptx2O70340 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Nptx2O70340 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nptx2O70340 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nptx2O70340 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nptx2O70340 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nptx2O70340 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Nptx2O70340 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Nptx2O70340 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Nptx2O70340 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nptx2O70340 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nptx2O70340 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nptx2O70340 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nptx2O70340 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Nptx2O70340 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Nptx2O70340 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nptx2O70340 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nptx2O70340 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nptx2O70340 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Nptx2O70340 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Nptx2O70340 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Nptx2O70340 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Nptx2O70340 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Nptx2O70340 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Nptx2O70340 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Nptx2O70340 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Nptx2O70340 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Nptx2O70340 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Nptx2O70340 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nptx2O70340 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nptx2O70340 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nptx2O70340 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nptx2O70340 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nptx2O70340 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Nptx2O70340 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nptx2O70340 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nptx2O70340 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nptx2O70340 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nptx2O70340 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nptx2O70340 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nptx2O70340 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nptx2O70340 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nptx2O70340 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nptx2O70340 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nptx2O70340 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nptx2O70340 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nptx2O70340 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nptx2O70340 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nptx2O70340 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nptx2O70340 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nptx2O70340 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nptx2O70340 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nptx2O70340 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nptx2O70340 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Nptx2O70340 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nptx2O70340 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nptx2O70340 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nptx2O70340 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nptx2O70340 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nptx2O70340 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Nptx2O70340 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nptx2O70340 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nptx2O70340 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nptx2O70340 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nptx2O70340 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nptx2O70340 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nptx2O70340 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nptx2O70340 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nptx2O70340 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nptx2O70340 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nptx2O70340 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nptx2O70340 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nptx2O70340 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nptx2O70340 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms