Protein–RNA interactions for Protein: O70126

Aurkb, Aurora kinase B, mousemouse

Predictions only

Length 345 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AurkbO70126 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
AurkbO70126 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
AurkbO70126 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
AurkbO70126 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
AurkbO70126 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
AurkbO70126 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
AurkbO70126 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
AurkbO70126 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
AurkbO70126 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
AurkbO70126 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
AurkbO70126 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
AurkbO70126 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
AurkbO70126 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
AurkbO70126 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
AurkbO70126 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
AurkbO70126 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
AurkbO70126 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
AurkbO70126 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
AurkbO70126 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
AurkbO70126 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
AurkbO70126 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
AurkbO70126 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
AurkbO70126 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
AurkbO70126 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
AurkbO70126 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
AurkbO70126 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
AurkbO70126 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
AurkbO70126 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
AurkbO70126 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
AurkbO70126 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
AurkbO70126 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
AurkbO70126 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
AurkbO70126 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
AurkbO70126 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
AurkbO70126 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
AurkbO70126 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
AurkbO70126 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
AurkbO70126 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
AurkbO70126 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
AurkbO70126 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
AurkbO70126 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
AurkbO70126 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
AurkbO70126 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
AurkbO70126 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
AurkbO70126 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
AurkbO70126 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
AurkbO70126 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
AurkbO70126 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
AurkbO70126 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
AurkbO70126 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
AurkbO70126 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
AurkbO70126 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
AurkbO70126 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
AurkbO70126 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
AurkbO70126 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
AurkbO70126 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
AurkbO70126 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
AurkbO70126 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
AurkbO70126 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
AurkbO70126 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
AurkbO70126 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
AurkbO70126 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
AurkbO70126 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
AurkbO70126 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
AurkbO70126 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
AurkbO70126 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
AurkbO70126 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
AurkbO70126 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
AurkbO70126 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
AurkbO70126 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
AurkbO70126 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
AurkbO70126 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
AurkbO70126 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
AurkbO70126 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
AurkbO70126 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
AurkbO70126 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
AurkbO70126 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
AurkbO70126 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
AurkbO70126 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
AurkbO70126 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
AurkbO70126 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
AurkbO70126 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
AurkbO70126 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
AurkbO70126 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
AurkbO70126 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
AurkbO70126 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
AurkbO70126 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
AurkbO70126 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
AurkbO70126 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
AurkbO70126 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
AurkbO70126 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
AurkbO70126 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
AurkbO70126 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
AurkbO70126 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
AurkbO70126 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
AurkbO70126 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
AurkbO70126 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
AurkbO70126 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
AurkbO70126 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
AurkbO70126 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.9 ms