Protein–RNA interactions for Protein: O54957

Lat, Linker for activation of T-cells family member 1, mousemouse

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LatO54957 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LatO54957 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LatO54957 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LatO54957 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LatO54957 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LatO54957 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LatO54957 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LatO54957 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LatO54957 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LatO54957 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LatO54957 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LatO54957 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LatO54957 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LatO54957 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LatO54957 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
LatO54957 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LatO54957 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LatO54957 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LatO54957 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LatO54957 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LatO54957 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LatO54957 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LatO54957 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LatO54957 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
LatO54957 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LatO54957 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LatO54957 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LatO54957 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LatO54957 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LatO54957 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LatO54957 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LatO54957 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LatO54957 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LatO54957 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LatO54957 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LatO54957 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LatO54957 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
LatO54957 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LatO54957 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LatO54957 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LatO54957 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LatO54957 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LatO54957 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LatO54957 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LatO54957 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LatO54957 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LatO54957 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LatO54957 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LatO54957 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LatO54957 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LatO54957 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LatO54957 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LatO54957 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LatO54957 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LatO54957 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LatO54957 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LatO54957 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
LatO54957 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LatO54957 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LatO54957 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LatO54957 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LatO54957 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LatO54957 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LatO54957 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LatO54957 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LatO54957 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LatO54957 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LatO54957 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LatO54957 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
LatO54957 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LatO54957 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LatO54957 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
LatO54957 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LatO54957 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LatO54957 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LatO54957 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
LatO54957 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LatO54957 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LatO54957 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LatO54957 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LatO54957 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LatO54957 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LatO54957 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LatO54957 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LatO54957 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LatO54957 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LatO54957 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LatO54957 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LatO54957 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
LatO54957 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LatO54957 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LatO54957 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LatO54957 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LatO54957 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LatO54957 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LatO54957 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LatO54957 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LatO54957 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LatO54957 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LatO54957 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms