Protein–RNA interactions for Protein: O54915

Nr1i2, Nuclear receptor subfamily 1 group I member 2, mousemouse

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr1i2O54915 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nr1i2O54915 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nr1i2O54915 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Nr1i2O54915 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nr1i2O54915 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nr1i2O54915 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nr1i2O54915 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nr1i2O54915 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nr1i2O54915 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nr1i2O54915 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nr1i2O54915 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nr1i2O54915 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Nr1i2O54915 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Nr1i2O54915 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Nr1i2O54915 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Nr1i2O54915 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Nr1i2O54915 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Nr1i2O54915 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Nr1i2O54915 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Nr1i2O54915 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Nr1i2O54915 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nr1i2O54915 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nr1i2O54915 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nr1i2O54915 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nr1i2O54915 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nr1i2O54915 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nr1i2O54915 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nr1i2O54915 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nr1i2O54915 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nr1i2O54915 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nr1i2O54915 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nr1i2O54915 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nr1i2O54915 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nr1i2O54915 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nr1i2O54915 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nr1i2O54915 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nr1i2O54915 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Nr1i2O54915 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nr1i2O54915 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nr1i2O54915 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nr1i2O54915 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nr1i2O54915 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Nr1i2O54915 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Nr1i2O54915 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Nr1i2O54915 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nr1i2O54915 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nr1i2O54915 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nr1i2O54915 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nr1i2O54915 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nr1i2O54915 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nr1i2O54915 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nr1i2O54915 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nr1i2O54915 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nr1i2O54915 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nr1i2O54915 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nr1i2O54915 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Nr1i2O54915 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nr1i2O54915 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nr1i2O54915 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nr1i2O54915 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nr1i2O54915 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nr1i2O54915 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nr1i2O54915 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nr1i2O54915 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nr1i2O54915 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nr1i2O54915 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nr1i2O54915 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nr1i2O54915 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nr1i2O54915 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nr1i2O54915 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nr1i2O54915 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nr1i2O54915 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nr1i2O54915 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Nr1i2O54915 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Nr1i2O54915 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Nr1i2O54915 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Nr1i2O54915 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Nr1i2O54915 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Nr1i2O54915 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nr1i2O54915 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nr1i2O54915 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nr1i2O54915 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nr1i2O54915 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nr1i2O54915 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nr1i2O54915 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nr1i2O54915 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Nr1i2O54915 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nr1i2O54915 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nr1i2O54915 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nr1i2O54915 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Nr1i2O54915 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nr1i2O54915 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nr1i2O54915 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nr1i2O54915 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nr1i2O54915 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nr1i2O54915 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nr1i2O54915 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nr1i2O54915 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nr1i2O54915 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nr1i2O54915 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms