Protein–RNA interactions for Protein: O54863

Tssk2, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tssk2O54863 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Tssk2O54863 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tssk2O54863 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tssk2O54863 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tssk2O54863 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tssk2O54863 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Tssk2O54863 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tssk2O54863 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tssk2O54863 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tssk2O54863 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tssk2O54863 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tssk2O54863 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tssk2O54863 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tssk2O54863 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tssk2O54863 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tssk2O54863 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tssk2O54863 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tssk2O54863 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Tssk2O54863 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tssk2O54863 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tssk2O54863 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tssk2O54863 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tssk2O54863 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tssk2O54863 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tssk2O54863 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tssk2O54863 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tssk2O54863 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tssk2O54863 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tssk2O54863 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tssk2O54863 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tssk2O54863 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tssk2O54863 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tssk2O54863 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tssk2O54863 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tssk2O54863 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tssk2O54863 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tssk2O54863 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tssk2O54863 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tssk2O54863 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tssk2O54863 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tssk2O54863 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Tssk2O54863 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tssk2O54863 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tssk2O54863 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tssk2O54863 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tssk2O54863 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Tssk2O54863 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tssk2O54863 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Tssk2O54863 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tssk2O54863 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Tssk2O54863 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Tssk2O54863 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tssk2O54863 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tssk2O54863 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tssk2O54863 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Tssk2O54863 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tssk2O54863 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Tssk2O54863 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Tssk2O54863 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tssk2O54863 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Tssk2O54863 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tssk2O54863 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Tssk2O54863 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Tssk2O54863 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tssk2O54863 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tssk2O54863 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tssk2O54863 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tssk2O54863 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Tssk2O54863 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tssk2O54863 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tssk2O54863 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tssk2O54863 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tssk2O54863 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tssk2O54863 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Tssk2O54863 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tssk2O54863 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tssk2O54863 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tssk2O54863 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tssk2O54863 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tssk2O54863 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tssk2O54863 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tssk2O54863 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tssk2O54863 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tssk2O54863 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tssk2O54863 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tssk2O54863 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tssk2O54863 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tssk2O54863 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tssk2O54863 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tssk2O54863 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tssk2O54863 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tssk2O54863 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tssk2O54863 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tssk2O54863 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tssk2O54863 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tssk2O54863 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tssk2O54863 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tssk2O54863 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tssk2O54863 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tssk2O54863 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms