Protein–RNA interactions for Protein: O54833

Csnk2a2, Casein kinase II subunit alpha', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk2a2O54833 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Csnk2a2O54833 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Csnk2a2O54833 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Csnk2a2O54833 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Csnk2a2O54833 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Csnk2a2O54833 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Csnk2a2O54833 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Csnk2a2O54833 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Csnk2a2O54833 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Csnk2a2O54833 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Csnk2a2O54833 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Csnk2a2O54833 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Csnk2a2O54833 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Csnk2a2O54833 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Csnk2a2O54833 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Csnk2a2O54833 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Csnk2a2O54833 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Csnk2a2O54833 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Csnk2a2O54833 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Csnk2a2O54833 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Csnk2a2O54833 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Csnk2a2O54833 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Csnk2a2O54833 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Csnk2a2O54833 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Csnk2a2O54833 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Csnk2a2O54833 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Csnk2a2O54833 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Csnk2a2O54833 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Csnk2a2O54833 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Csnk2a2O54833 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Csnk2a2O54833 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Csnk2a2O54833 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Csnk2a2O54833 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Csnk2a2O54833 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Csnk2a2O54833 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Csnk2a2O54833 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Csnk2a2O54833 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Csnk2a2O54833 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Csnk2a2O54833 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Csnk2a2O54833 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Csnk2a2O54833 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Csnk2a2O54833 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Csnk2a2O54833 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Csnk2a2O54833 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Csnk2a2O54833 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Csnk2a2O54833 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Csnk2a2O54833 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Csnk2a2O54833 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Csnk2a2O54833 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Csnk2a2O54833 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Csnk2a2O54833 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Csnk2a2O54833 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Csnk2a2O54833 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Csnk2a2O54833 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Csnk2a2O54833 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Csnk2a2O54833 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Csnk2a2O54833 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Csnk2a2O54833 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Csnk2a2O54833 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Csnk2a2O54833 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Csnk2a2O54833 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Csnk2a2O54833 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Csnk2a2O54833 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Csnk2a2O54833 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Csnk2a2O54833 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Csnk2a2O54833 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Csnk2a2O54833 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Csnk2a2O54833 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Csnk2a2O54833 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Csnk2a2O54833 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Csnk2a2O54833 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Csnk2a2O54833 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Csnk2a2O54833 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Csnk2a2O54833 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Csnk2a2O54833 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Csnk2a2O54833 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Csnk2a2O54833 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Csnk2a2O54833 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Csnk2a2O54833 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Csnk2a2O54833 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Csnk2a2O54833 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Csnk2a2O54833 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Csnk2a2O54833 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Csnk2a2O54833 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Csnk2a2O54833 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Csnk2a2O54833 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Csnk2a2O54833 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Csnk2a2O54833 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Csnk2a2O54833 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Csnk2a2O54833 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Csnk2a2O54833 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Csnk2a2O54833 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Csnk2a2O54833 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Csnk2a2O54833 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Csnk2a2O54833 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Csnk2a2O54833 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Csnk2a2O54833 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Csnk2a2O54833 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Csnk2a2O54833 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Csnk2a2O54833 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms