Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DffaO54786 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DffaO54786 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DffaO54786 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DffaO54786 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DffaO54786 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
DffaO54786 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DffaO54786 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DffaO54786 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
DffaO54786 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DffaO54786 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DffaO54786 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
DffaO54786 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
DffaO54786 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
DffaO54786 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DffaO54786 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
DffaO54786 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DffaO54786 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
DffaO54786 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DffaO54786 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DffaO54786 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DffaO54786 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DffaO54786 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DffaO54786 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DffaO54786 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DffaO54786 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DffaO54786 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DffaO54786 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DffaO54786 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DffaO54786 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DffaO54786 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DffaO54786 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DffaO54786 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DffaO54786 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DffaO54786 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
DffaO54786 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
DffaO54786 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
DffaO54786 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
DffaO54786 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
DffaO54786 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DffaO54786 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DffaO54786 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DffaO54786 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
DffaO54786 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
DffaO54786 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DffaO54786 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
DffaO54786 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DffaO54786 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DffaO54786 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DffaO54786 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DffaO54786 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DffaO54786 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DffaO54786 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DffaO54786 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DffaO54786 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DffaO54786 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DffaO54786 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DffaO54786 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DffaO54786 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DffaO54786 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DffaO54786 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DffaO54786 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DffaO54786 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DffaO54786 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DffaO54786 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DffaO54786 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DffaO54786 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DffaO54786 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DffaO54786 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
DffaO54786 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DffaO54786 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DffaO54786 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DffaO54786 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DffaO54786 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DffaO54786 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DffaO54786 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DffaO54786 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DffaO54786 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DffaO54786 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
DffaO54786 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
DffaO54786 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DffaO54786 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DffaO54786 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
DffaO54786 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DffaO54786 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DffaO54786 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DffaO54786 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DffaO54786 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DffaO54786 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DffaO54786 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DffaO54786 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DffaO54786 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DffaO54786 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DffaO54786 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DffaO54786 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DffaO54786 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DffaO54786 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DffaO54786 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DffaO54786 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DffaO54786 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms