Protein–RNA interactions for Protein: O54689

Ccr6, C-C chemokine receptor type 6, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr6O54689 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccr6O54689 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccr6O54689 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccr6O54689 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ccr6O54689 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccr6O54689 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccr6O54689 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccr6O54689 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccr6O54689 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccr6O54689 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccr6O54689 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccr6O54689 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccr6O54689 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccr6O54689 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccr6O54689 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccr6O54689 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccr6O54689 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccr6O54689 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccr6O54689 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccr6O54689 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccr6O54689 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccr6O54689 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccr6O54689 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccr6O54689 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccr6O54689 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccr6O54689 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccr6O54689 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccr6O54689 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccr6O54689 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccr6O54689 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccr6O54689 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccr6O54689 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccr6O54689 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccr6O54689 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccr6O54689 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccr6O54689 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccr6O54689 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccr6O54689 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccr6O54689 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccr6O54689 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccr6O54689 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccr6O54689 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccr6O54689 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccr6O54689 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccr6O54689 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccr6O54689 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccr6O54689 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccr6O54689 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccr6O54689 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccr6O54689 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccr6O54689 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccr6O54689 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccr6O54689 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccr6O54689 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccr6O54689 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccr6O54689 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccr6O54689 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccr6O54689 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccr6O54689 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccr6O54689 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccr6O54689 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccr6O54689 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccr6O54689 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccr6O54689 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccr6O54689 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccr6O54689 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccr6O54689 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccr6O54689 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccr6O54689 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccr6O54689 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccr6O54689 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccr6O54689 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccr6O54689 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccr6O54689 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccr6O54689 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccr6O54689 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccr6O54689 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccr6O54689 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccr6O54689 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccr6O54689 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccr6O54689 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccr6O54689 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccr6O54689 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccr6O54689 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccr6O54689 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccr6O54689 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccr6O54689 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccr6O54689 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccr6O54689 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccr6O54689 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccr6O54689 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccr6O54689 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccr6O54689 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccr6O54689 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccr6O54689 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccr6O54689 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccr6O54689 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccr6O54689 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccr6O54689 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccr6O54689 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms