Protein–RNA interactions for Protein: O35493

Clk4, Dual specificity protein kinase CLK4, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk4O35493 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Clk4O35493 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Clk4O35493 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Clk4O35493 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Clk4O35493 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Clk4O35493 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Clk4O35493 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Clk4O35493 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Clk4O35493 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Clk4O35493 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Clk4O35493 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Clk4O35493 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Clk4O35493 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Clk4O35493 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Clk4O35493 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Clk4O35493 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Clk4O35493 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Clk4O35493 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Clk4O35493 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Clk4O35493 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Clk4O35493 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Clk4O35493 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Clk4O35493 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Clk4O35493 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Clk4O35493 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Clk4O35493 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Clk4O35493 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Clk4O35493 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Clk4O35493 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Clk4O35493 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Clk4O35493 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Clk4O35493 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Clk4O35493 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Clk4O35493 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Clk4O35493 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Clk4O35493 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Clk4O35493 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Clk4O35493 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Clk4O35493 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Clk4O35493 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Clk4O35493 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Clk4O35493 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Clk4O35493 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Clk4O35493 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Clk4O35493 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Clk4O35493 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Clk4O35493 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Clk4O35493 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Clk4O35493 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Clk4O35493 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Clk4O35493 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Clk4O35493 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Clk4O35493 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Clk4O35493 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Clk4O35493 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Clk4O35493 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Clk4O35493 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Clk4O35493 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Clk4O35493 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Clk4O35493 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Clk4O35493 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Clk4O35493 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Clk4O35493 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Clk4O35493 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Clk4O35493 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Clk4O35493 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Clk4O35493 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Clk4O35493 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Clk4O35493 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Clk4O35493 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Clk4O35493 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Clk4O35493 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Clk4O35493 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Clk4O35493 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Clk4O35493 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Clk4O35493 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Clk4O35493 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Clk4O35493 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Clk4O35493 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Clk4O35493 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Clk4O35493 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Clk4O35493 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Clk4O35493 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Clk4O35493 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Clk4O35493 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Clk4O35493 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Clk4O35493 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Clk4O35493 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Clk4O35493 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Clk4O35493 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Clk4O35493 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Clk4O35493 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Clk4O35493 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Clk4O35493 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Clk4O35493 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Clk4O35493 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Clk4O35493 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Clk4O35493 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Clk4O35493 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Clk4O35493 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms