Protein–RNA interactions for Protein: O35379

Abcc1, Multidrug resistance-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc1O35379 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
Abcc1O35379 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC36.05■■■■□ 3.36
Abcc1O35379 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
Abcc1O35379 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
Abcc1O35379 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.04■■■■□ 3.36
Abcc1O35379 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
Abcc1O35379 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
Abcc1O35379 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
Abcc1O35379 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
Abcc1O35379 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
Abcc1O35379 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
Abcc1O35379 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
Abcc1O35379 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
Abcc1O35379 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
Abcc1O35379 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
Abcc1O35379 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
Abcc1O35379 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC35.99■■■■□ 3.35
Abcc1O35379 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
Abcc1O35379 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.99■■■■□ 3.35
Abcc1O35379 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.98■■■■□ 3.35
Abcc1O35379 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
Abcc1O35379 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
Abcc1O35379 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC35.98■■■■□ 3.35
Abcc1O35379 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC35.97■■■■□ 3.35
Abcc1O35379 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
Abcc1O35379 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
Abcc1O35379 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
Abcc1O35379 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC35.96■■■■□ 3.35
Abcc1O35379 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.95■■■■□ 3.35
Abcc1O35379 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC35.95■■■■□ 3.35
Abcc1O35379 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
Abcc1O35379 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
Abcc1O35379 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC35.94■■■■□ 3.34
Abcc1O35379 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC35.94■■■■□ 3.34
Abcc1O35379 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Abcc1O35379 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
Abcc1O35379 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
Abcc1O35379 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
Abcc1O35379 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
Abcc1O35379 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Abcc1O35379 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Abcc1O35379 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
Abcc1O35379 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
Abcc1O35379 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
Abcc1O35379 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
Abcc1O35379 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.9■■■■□ 3.34
Abcc1O35379 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC35.89■■■■□ 3.34
Abcc1O35379 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC35.89■■■■□ 3.34
Abcc1O35379 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Abcc1O35379 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC35.88■■■■□ 3.33
Abcc1O35379 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC35.88■■■■□ 3.33
Abcc1O35379 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
Abcc1O35379 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
Abcc1O35379 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
Abcc1O35379 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
Abcc1O35379 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
Abcc1O35379 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC35.86■■■■□ 3.33
Abcc1O35379 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
Abcc1O35379 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
Abcc1O35379 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC35.85■■■■□ 3.33
Abcc1O35379 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC35.83■■■■□ 3.33
Abcc1O35379 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
Abcc1O35379 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC35.83■■■■□ 3.33
Abcc1O35379 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC35.83■■■■□ 3.33
Abcc1O35379 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
Abcc1O35379 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
Abcc1O35379 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC35.83■■■■□ 3.33
Abcc1O35379 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
Abcc1O35379 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
Abcc1O35379 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC35.81■■■■□ 3.32
Abcc1O35379 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
Abcc1O35379 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
Abcc1O35379 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC35.79■■■■□ 3.32
Abcc1O35379 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
Abcc1O35379 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
Abcc1O35379 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
Abcc1O35379 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
Abcc1O35379 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC35.78■■■■□ 3.32
Abcc1O35379 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC35.78■■■■□ 3.32
Abcc1O35379 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
Abcc1O35379 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC35.77■■■■□ 3.32
Abcc1O35379 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.76■■■■□ 3.32
Abcc1O35379 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC35.76■■■■□ 3.32
Abcc1O35379 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
Abcc1O35379 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC35.76■■■■□ 3.31
Abcc1O35379 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
Abcc1O35379 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
Abcc1O35379 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC35.74■■■■□ 3.31
Abcc1O35379 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC35.74■■■■□ 3.31
Abcc1O35379 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
Abcc1O35379 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC35.73■■■■□ 3.31
Abcc1O35379 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC35.73■■■■□ 3.31
Abcc1O35379 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
Abcc1O35379 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC35.72■■■■□ 3.31
Abcc1O35379 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.72■■■■□ 3.31
Abcc1O35379 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC35.72■■■■□ 3.31
Abcc1O35379 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
Abcc1O35379 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
Abcc1O35379 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
Abcc1O35379 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms