Protein–RNA interactions for Protein: O35324

Sh2d1b, SH2 domain-containing protein 1B, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d1bO35324 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Sh2d1bO35324 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sh2d1bO35324 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sh2d1bO35324 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sh2d1bO35324 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sh2d1bO35324 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sh2d1bO35324 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sh2d1bO35324 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sh2d1bO35324 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sh2d1bO35324 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sh2d1bO35324 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sh2d1bO35324 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sh2d1bO35324 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sh2d1bO35324 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sh2d1bO35324 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sh2d1bO35324 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sh2d1bO35324 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sh2d1bO35324 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sh2d1bO35324 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sh2d1bO35324 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sh2d1bO35324 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sh2d1bO35324 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sh2d1bO35324 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sh2d1bO35324 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sh2d1bO35324 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sh2d1bO35324 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sh2d1bO35324 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sh2d1bO35324 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sh2d1bO35324 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sh2d1bO35324 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sh2d1bO35324 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sh2d1bO35324 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Sh2d1bO35324 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sh2d1bO35324 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sh2d1bO35324 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sh2d1bO35324 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sh2d1bO35324 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sh2d1bO35324 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sh2d1bO35324 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sh2d1bO35324 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sh2d1bO35324 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sh2d1bO35324 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sh2d1bO35324 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sh2d1bO35324 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sh2d1bO35324 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sh2d1bO35324 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sh2d1bO35324 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sh2d1bO35324 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sh2d1bO35324 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sh2d1bO35324 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Sh2d1bO35324 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sh2d1bO35324 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sh2d1bO35324 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sh2d1bO35324 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sh2d1bO35324 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sh2d1bO35324 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sh2d1bO35324 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Sh2d1bO35324 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sh2d1bO35324 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sh2d1bO35324 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sh2d1bO35324 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sh2d1bO35324 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sh2d1bO35324 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sh2d1bO35324 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sh2d1bO35324 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sh2d1bO35324 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sh2d1bO35324 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sh2d1bO35324 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sh2d1bO35324 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sh2d1bO35324 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Sh2d1bO35324 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sh2d1bO35324 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Sh2d1bO35324 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sh2d1bO35324 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sh2d1bO35324 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sh2d1bO35324 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sh2d1bO35324 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sh2d1bO35324 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sh2d1bO35324 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sh2d1bO35324 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sh2d1bO35324 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sh2d1bO35324 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sh2d1bO35324 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sh2d1bO35324 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sh2d1bO35324 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sh2d1bO35324 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sh2d1bO35324 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sh2d1bO35324 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sh2d1bO35324 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sh2d1bO35324 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sh2d1bO35324 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Sh2d1bO35324 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sh2d1bO35324 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sh2d1bO35324 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sh2d1bO35324 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Sh2d1bO35324 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Sh2d1bO35324 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sh2d1bO35324 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sh2d1bO35324 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sh2d1bO35324 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms