Protein–RNA interactions for Protein: O35310

Hs3st1, Heparan sulfate glucosamine 3-O-sulfotransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hs3st1O35310 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hs3st1O35310 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hs3st1O35310 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hs3st1O35310 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hs3st1O35310 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hs3st1O35310 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hs3st1O35310 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hs3st1O35310 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Hs3st1O35310 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hs3st1O35310 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hs3st1O35310 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hs3st1O35310 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Hs3st1O35310 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Hs3st1O35310 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hs3st1O35310 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hs3st1O35310 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hs3st1O35310 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hs3st1O35310 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hs3st1O35310 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hs3st1O35310 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hs3st1O35310 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hs3st1O35310 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hs3st1O35310 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hs3st1O35310 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hs3st1O35310 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hs3st1O35310 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hs3st1O35310 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hs3st1O35310 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hs3st1O35310 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hs3st1O35310 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hs3st1O35310 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hs3st1O35310 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hs3st1O35310 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hs3st1O35310 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hs3st1O35310 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hs3st1O35310 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hs3st1O35310 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hs3st1O35310 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hs3st1O35310 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hs3st1O35310 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hs3st1O35310 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hs3st1O35310 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hs3st1O35310 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hs3st1O35310 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Hs3st1O35310 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hs3st1O35310 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hs3st1O35310 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hs3st1O35310 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hs3st1O35310 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hs3st1O35310 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hs3st1O35310 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hs3st1O35310 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hs3st1O35310 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hs3st1O35310 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hs3st1O35310 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hs3st1O35310 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hs3st1O35310 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hs3st1O35310 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hs3st1O35310 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Hs3st1O35310 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hs3st1O35310 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hs3st1O35310 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hs3st1O35310 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Hs3st1O35310 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hs3st1O35310 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hs3st1O35310 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hs3st1O35310 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hs3st1O35310 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hs3st1O35310 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Hs3st1O35310 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hs3st1O35310 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Hs3st1O35310 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Hs3st1O35310 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hs3st1O35310 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hs3st1O35310 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Hs3st1O35310 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hs3st1O35310 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hs3st1O35310 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hs3st1O35310 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hs3st1O35310 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Hs3st1O35310 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hs3st1O35310 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hs3st1O35310 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hs3st1O35310 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hs3st1O35310 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hs3st1O35310 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Hs3st1O35310 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hs3st1O35310 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hs3st1O35310 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hs3st1O35310 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Hs3st1O35310 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hs3st1O35310 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hs3st1O35310 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hs3st1O35310 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hs3st1O35310 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hs3st1O35310 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hs3st1O35310 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hs3st1O35310 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hs3st1O35310 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hs3st1O35310 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms