Protein–RNA interactions for Protein: O35309

Nmi, N-myc-interactor, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NmiO35309 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
NmiO35309 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NmiO35309 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
NmiO35309 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NmiO35309 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NmiO35309 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NmiO35309 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NmiO35309 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NmiO35309 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NmiO35309 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NmiO35309 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NmiO35309 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NmiO35309 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NmiO35309 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NmiO35309 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NmiO35309 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NmiO35309 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NmiO35309 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NmiO35309 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NmiO35309 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NmiO35309 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NmiO35309 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NmiO35309 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NmiO35309 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NmiO35309 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NmiO35309 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NmiO35309 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NmiO35309 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NmiO35309 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NmiO35309 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NmiO35309 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NmiO35309 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NmiO35309 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NmiO35309 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NmiO35309 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NmiO35309 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NmiO35309 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NmiO35309 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NmiO35309 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NmiO35309 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NmiO35309 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NmiO35309 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NmiO35309 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NmiO35309 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NmiO35309 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NmiO35309 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NmiO35309 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NmiO35309 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NmiO35309 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NmiO35309 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NmiO35309 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NmiO35309 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NmiO35309 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NmiO35309 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NmiO35309 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
NmiO35309 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NmiO35309 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NmiO35309 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NmiO35309 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
NmiO35309 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NmiO35309 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NmiO35309 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NmiO35309 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NmiO35309 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NmiO35309 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
NmiO35309 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NmiO35309 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NmiO35309 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NmiO35309 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NmiO35309 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NmiO35309 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NmiO35309 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NmiO35309 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NmiO35309 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NmiO35309 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NmiO35309 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NmiO35309 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NmiO35309 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NmiO35309 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NmiO35309 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NmiO35309 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NmiO35309 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NmiO35309 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NmiO35309 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
NmiO35309 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NmiO35309 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NmiO35309 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
NmiO35309 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
NmiO35309 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NmiO35309 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NmiO35309 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NmiO35309 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NmiO35309 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NmiO35309 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NmiO35309 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NmiO35309 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NmiO35309 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NmiO35309 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NmiO35309 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NmiO35309 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms