Protein–RNA interactions for Protein: O08740

Polr2j, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2jO08740 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Polr2jO08740 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Polr2jO08740 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Polr2jO08740 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Polr2jO08740 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Polr2jO08740 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Polr2jO08740 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Polr2jO08740 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Polr2jO08740 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Polr2jO08740 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Polr2jO08740 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Polr2jO08740 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Polr2jO08740 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Polr2jO08740 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Polr2jO08740 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Polr2jO08740 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Polr2jO08740 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Polr2jO08740 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Polr2jO08740 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Polr2jO08740 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Polr2jO08740 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Polr2jO08740 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Polr2jO08740 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Polr2jO08740 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Polr2jO08740 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Polr2jO08740 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Polr2jO08740 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Polr2jO08740 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Polr2jO08740 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Polr2jO08740 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Polr2jO08740 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Polr2jO08740 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Polr2jO08740 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Polr2jO08740 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Polr2jO08740 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Polr2jO08740 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Polr2jO08740 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Polr2jO08740 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Polr2jO08740 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Polr2jO08740 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Polr2jO08740 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Polr2jO08740 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Polr2jO08740 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Polr2jO08740 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Polr2jO08740 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Polr2jO08740 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Polr2jO08740 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Polr2jO08740 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Polr2jO08740 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Polr2jO08740 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Polr2jO08740 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Polr2jO08740 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Polr2jO08740 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Polr2jO08740 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Polr2jO08740 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Polr2jO08740 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Polr2jO08740 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Polr2jO08740 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Polr2jO08740 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Polr2jO08740 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Polr2jO08740 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Polr2jO08740 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Polr2jO08740 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Polr2jO08740 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Polr2jO08740 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Polr2jO08740 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Polr2jO08740 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Polr2jO08740 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Polr2jO08740 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Polr2jO08740 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Polr2jO08740 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Polr2jO08740 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Polr2jO08740 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Polr2jO08740 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Polr2jO08740 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Polr2jO08740 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Polr2jO08740 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Polr2jO08740 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Polr2jO08740 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Polr2jO08740 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Polr2jO08740 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Polr2jO08740 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Polr2jO08740 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Polr2jO08740 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Polr2jO08740 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Polr2jO08740 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Polr2jO08740 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Polr2jO08740 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Polr2jO08740 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Polr2jO08740 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Polr2jO08740 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Polr2jO08740 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Polr2jO08740 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Polr2jO08740 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Polr2jO08740 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Polr2jO08740 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Polr2jO08740 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Polr2jO08740 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Polr2jO08740 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Polr2jO08740 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.4 ms