Protein–RNA interactions for Protein: L7N243

Gm20939, Predicted gene, 20939, mousemouse

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Length 523 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20939L7N243 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gm20939L7N243 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gm20939L7N243 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gm20939L7N243 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Gm20939L7N243 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gm20939L7N243 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gm20939L7N243 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gm20939L7N243 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gm20939L7N243 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Gm20939L7N243 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gm20939L7N243 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gm20939L7N243 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gm20939L7N243 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gm20939L7N243 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gm20939L7N243 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gm20939L7N243 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gm20939L7N243 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gm20939L7N243 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gm20939L7N243 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Gm20939L7N243 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gm20939L7N243 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gm20939L7N243 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gm20939L7N243 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gm20939L7N243 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gm20939L7N243 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gm20939L7N243 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gm20939L7N243 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gm20939L7N243 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gm20939L7N243 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gm20939L7N243 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gm20939L7N243 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gm20939L7N243 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gm20939L7N243 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gm20939L7N243 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gm20939L7N243 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gm20939L7N243 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gm20939L7N243 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Gm20939L7N243 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gm20939L7N243 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gm20939L7N243 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gm20939L7N243 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gm20939L7N243 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gm20939L7N243 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gm20939L7N243 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gm20939L7N243 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gm20939L7N243 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gm20939L7N243 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gm20939L7N243 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gm20939L7N243 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Gm20939L7N243 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gm20939L7N243 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gm20939L7N243 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gm20939L7N243 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gm20939L7N243 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gm20939L7N243 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Gm20939L7N243 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gm20939L7N243 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gm20939L7N243 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gm20939L7N243 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Gm20939L7N243 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gm20939L7N243 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gm20939L7N243 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gm20939L7N243 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gm20939L7N243 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gm20939L7N243 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gm20939L7N243 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gm20939L7N243 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gm20939L7N243 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gm20939L7N243 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gm20939L7N243 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gm20939L7N243 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gm20939L7N243 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gm20939L7N243 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gm20939L7N243 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gm20939L7N243 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gm20939L7N243 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gm20939L7N243 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gm20939L7N243 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gm20939L7N243 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gm20939L7N243 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gm20939L7N243 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gm20939L7N243 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gm20939L7N243 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gm20939L7N243 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gm20939L7N243 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gm20939L7N243 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gm20939L7N243 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.74
Gm20939L7N243 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gm20939L7N243 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Gm20939L7N243 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gm20939L7N243 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gm20939L7N243 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gm20939L7N243 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gm20939L7N243 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gm20939L7N243 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gm20939L7N243 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gm20939L7N243 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gm20939L7N243 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gm20939L7N243 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gm20939L7N243 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
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