Protein–RNA interactions for Protein: J3QNY8

Gm19965, Predicted gene, 19965, mousemouse

Predictions only

Length 723 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm19965J3QNY8 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm19965J3QNY8 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm19965J3QNY8 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm19965J3QNY8 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm19965J3QNY8 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm19965J3QNY8 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm19965J3QNY8 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm19965J3QNY8 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm19965J3QNY8 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm19965J3QNY8 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm19965J3QNY8 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm19965J3QNY8 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm19965J3QNY8 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm19965J3QNY8 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm19965J3QNY8 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gm19965J3QNY8 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gm19965J3QNY8 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gm19965J3QNY8 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Gm19965J3QNY8 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gm19965J3QNY8 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gm19965J3QNY8 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gm19965J3QNY8 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gm19965J3QNY8 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gm19965J3QNY8 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Gm19965J3QNY8 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gm19965J3QNY8 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gm19965J3QNY8 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Gm19965J3QNY8 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gm19965J3QNY8 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gm19965J3QNY8 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gm19965J3QNY8 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gm19965J3QNY8 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gm19965J3QNY8 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gm19965J3QNY8 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gm19965J3QNY8 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gm19965J3QNY8 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gm19965J3QNY8 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gm19965J3QNY8 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gm19965J3QNY8 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gm19965J3QNY8 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
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Gm19965J3QNY8 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gm19965J3QNY8 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gm19965J3QNY8 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gm19965J3QNY8 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Gm19965J3QNY8 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gm19965J3QNY8 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gm19965J3QNY8 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gm19965J3QNY8 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gm19965J3QNY8 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Gm19965J3QNY8 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gm19965J3QNY8 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Gm19965J3QNY8 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gm19965J3QNY8 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gm19965J3QNY8 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gm19965J3QNY8 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gm19965J3QNY8 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gm19965J3QNY8 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gm19965J3QNY8 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gm19965J3QNY8 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gm19965J3QNY8 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gm19965J3QNY8 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
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Gm19965J3QNY8 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Gm19965J3QNY8 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gm19965J3QNY8 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
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Gm19965J3QNY8 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gm19965J3QNY8 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gm19965J3QNY8 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
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Gm19965J3QNY8 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gm19965J3QNY8 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gm19965J3QNY8 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gm19965J3QNY8 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gm19965J3QNY8 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gm19965J3QNY8 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gm19965J3QNY8 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gm19965J3QNY8 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gm19965J3QNY8 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gm19965J3QNY8 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Gm19965J3QNY8 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gm19965J3QNY8 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gm19965J3QNY8 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gm19965J3QNY8 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gm19965J3QNY8 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gm19965J3QNY8 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gm19965J3QNY8 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gm19965J3QNY8 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gm19965J3QNY8 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gm19965J3QNY8 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gm19965J3QNY8 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gm19965J3QNY8 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gm19965J3QNY8 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gm19965J3QNY8 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gm19965J3QNY8 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gm19965J3QNY8 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gm19965J3QNY8 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gm19965J3QNY8 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gm19965J3QNY8 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
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