Protein–RNA interactions for Protein: J3QMW9

Btbd35f6, BTB domain-containing 35, family member 6, mousemouse

Predictions only

Length 498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Btbd35f6J3QMW9 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Btbd35f6J3QMW9 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Btbd35f6J3QMW9 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Btbd35f6J3QMW9 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Btbd35f6J3QMW9 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Btbd35f6J3QMW9 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Btbd35f6J3QMW9 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Btbd35f6J3QMW9 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Btbd35f6J3QMW9 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Btbd35f6J3QMW9 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Btbd35f6J3QMW9 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Btbd35f6J3QMW9 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Btbd35f6J3QMW9 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Btbd35f6J3QMW9 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Btbd35f6J3QMW9 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Btbd35f6J3QMW9 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Btbd35f6J3QMW9 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Btbd35f6J3QMW9 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Btbd35f6J3QMW9 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Btbd35f6J3QMW9 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Btbd35f6J3QMW9 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Btbd35f6J3QMW9 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Btbd35f6J3QMW9 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Btbd35f6J3QMW9 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Btbd35f6J3QMW9 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Btbd35f6J3QMW9 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Btbd35f6J3QMW9 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Btbd35f6J3QMW9 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Btbd35f6J3QMW9 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Btbd35f6J3QMW9 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Btbd35f6J3QMW9 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Btbd35f6J3QMW9 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Btbd35f6J3QMW9 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Btbd35f6J3QMW9 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Btbd35f6J3QMW9 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Btbd35f6J3QMW9 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Btbd35f6J3QMW9 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Btbd35f6J3QMW9 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Btbd35f6J3QMW9 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Btbd35f6J3QMW9 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Btbd35f6J3QMW9 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Btbd35f6J3QMW9 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Btbd35f6J3QMW9 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Btbd35f6J3QMW9 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Btbd35f6J3QMW9 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Btbd35f6J3QMW9 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Btbd35f6J3QMW9 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Btbd35f6J3QMW9 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Btbd35f6J3QMW9 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Btbd35f6J3QMW9 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Btbd35f6J3QMW9 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Btbd35f6J3QMW9 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Btbd35f6J3QMW9 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Btbd35f6J3QMW9 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Btbd35f6J3QMW9 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Btbd35f6J3QMW9 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Btbd35f6J3QMW9 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Btbd35f6J3QMW9 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Btbd35f6J3QMW9 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Btbd35f6J3QMW9 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Btbd35f6J3QMW9 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Btbd35f6J3QMW9 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Btbd35f6J3QMW9 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Btbd35f6J3QMW9 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Btbd35f6J3QMW9 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Btbd35f6J3QMW9 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Btbd35f6J3QMW9 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Btbd35f6J3QMW9 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Btbd35f6J3QMW9 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Btbd35f6J3QMW9 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Btbd35f6J3QMW9 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Btbd35f6J3QMW9 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Btbd35f6J3QMW9 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Btbd35f6J3QMW9 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Btbd35f6J3QMW9 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Btbd35f6J3QMW9 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Btbd35f6J3QMW9 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Btbd35f6J3QMW9 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Btbd35f6J3QMW9 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Btbd35f6J3QMW9 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Btbd35f6J3QMW9 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Btbd35f6J3QMW9 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Btbd35f6J3QMW9 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Btbd35f6J3QMW9 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Btbd35f6J3QMW9 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Btbd35f6J3QMW9 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Btbd35f6J3QMW9 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Btbd35f6J3QMW9 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Btbd35f6J3QMW9 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Btbd35f6J3QMW9 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Btbd35f6J3QMW9 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Btbd35f6J3QMW9 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Btbd35f6J3QMW9 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Btbd35f6J3QMW9 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Btbd35f6J3QMW9 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Btbd35f6J3QMW9 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Btbd35f6J3QMW9 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Btbd35f6J3QMW9 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Btbd35f6J3QMW9 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Btbd35f6J3QMW9 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms