Protein–RNA interactions for Protein: J3KML6

Gm20830, Predicted gene, 20830, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20830J3KML6 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm20830J3KML6 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm20830J3KML6 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm20830J3KML6 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm20830J3KML6 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm20830J3KML6 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm20830J3KML6 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm20830J3KML6 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm20830J3KML6 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm20830J3KML6 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm20830J3KML6 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm20830J3KML6 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm20830J3KML6 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm20830J3KML6 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm20830J3KML6 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm20830J3KML6 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm20830J3KML6 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm20830J3KML6 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm20830J3KML6 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm20830J3KML6 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm20830J3KML6 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm20830J3KML6 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm20830J3KML6 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm20830J3KML6 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm20830J3KML6 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm20830J3KML6 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm20830J3KML6 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm20830J3KML6 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm20830J3KML6 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm20830J3KML6 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm20830J3KML6 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm20830J3KML6 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm20830J3KML6 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gm20830J3KML6 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gm20830J3KML6 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gm20830J3KML6 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gm20830J3KML6 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm20830J3KML6 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm20830J3KML6 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm20830J3KML6 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm20830J3KML6 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm20830J3KML6 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm20830J3KML6 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm20830J3KML6 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm20830J3KML6 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm20830J3KML6 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm20830J3KML6 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm20830J3KML6 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm20830J3KML6 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm20830J3KML6 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm20830J3KML6 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm20830J3KML6 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm20830J3KML6 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm20830J3KML6 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm20830J3KML6 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm20830J3KML6 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm20830J3KML6 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm20830J3KML6 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm20830J3KML6 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm20830J3KML6 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm20830J3KML6 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm20830J3KML6 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm20830J3KML6 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm20830J3KML6 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm20830J3KML6 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm20830J3KML6 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm20830J3KML6 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm20830J3KML6 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm20830J3KML6 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm20830J3KML6 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm20830J3KML6 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm20830J3KML6 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm20830J3KML6 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm20830J3KML6 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm20830J3KML6 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm20830J3KML6 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm20830J3KML6 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm20830J3KML6 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm20830J3KML6 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm20830J3KML6 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm20830J3KML6 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Gm20830J3KML6 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm20830J3KML6 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm20830J3KML6 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm20830J3KML6 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm20830J3KML6 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm20830J3KML6 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm20830J3KML6 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm20830J3KML6 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm20830J3KML6 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm20830J3KML6 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm20830J3KML6 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm20830J3KML6 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm20830J3KML6 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm20830J3KML6 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm20830J3KML6 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm20830J3KML6 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm20830J3KML6 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm20830J3KML6 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm20830J3KML6 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
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