Protein–RNA interactions for Protein: G3X952

Zkscan2, MCG20985, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zkscan2G3X952 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Zkscan2G3X952 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Zkscan2G3X952 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Zkscan2G3X952 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Zkscan2G3X952 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Zkscan2G3X952 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Zkscan2G3X952 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Zkscan2G3X952 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Zkscan2G3X952 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Zkscan2G3X952 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Zkscan2G3X952 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Zkscan2G3X952 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Zkscan2G3X952 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Zkscan2G3X952 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Zkscan2G3X952 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Zkscan2G3X952 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Zkscan2G3X952 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Zkscan2G3X952 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Zkscan2G3X952 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Zkscan2G3X952 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Zkscan2G3X952 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Zkscan2G3X952 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Zkscan2G3X952 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Zkscan2G3X952 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Zkscan2G3X952 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Zkscan2G3X952 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Zkscan2G3X952 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Zkscan2G3X952 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Zkscan2G3X952 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Zkscan2G3X952 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Zkscan2G3X952 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Zkscan2G3X952 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Zkscan2G3X952 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Zkscan2G3X952 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Zkscan2G3X952 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Zkscan2G3X952 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Zkscan2G3X952 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Zkscan2G3X952 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Zkscan2G3X952 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Zkscan2G3X952 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Zkscan2G3X952 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Zkscan2G3X952 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Zkscan2G3X952 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Zkscan2G3X952 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Zkscan2G3X952 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Zkscan2G3X952 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Zkscan2G3X952 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Zkscan2G3X952 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Zkscan2G3X952 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Zkscan2G3X952 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Zkscan2G3X952 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Zkscan2G3X952 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Zkscan2G3X952 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Zkscan2G3X952 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Zkscan2G3X952 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Zkscan2G3X952 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Zkscan2G3X952 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Zkscan2G3X952 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Zkscan2G3X952 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Zkscan2G3X952 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Zkscan2G3X952 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Zkscan2G3X952 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Zkscan2G3X952 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Zkscan2G3X952 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Zkscan2G3X952 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Zkscan2G3X952 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Zkscan2G3X952 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Zkscan2G3X952 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Zkscan2G3X952 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Zkscan2G3X952 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Zkscan2G3X952 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Zkscan2G3X952 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Zkscan2G3X952 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Zkscan2G3X952 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Zkscan2G3X952 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Zkscan2G3X952 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Zkscan2G3X952 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Zkscan2G3X952 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Zkscan2G3X952 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Zkscan2G3X952 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Zkscan2G3X952 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Zkscan2G3X952 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Zkscan2G3X952 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Zkscan2G3X952 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Zkscan2G3X952 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Zkscan2G3X952 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Zkscan2G3X952 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Zkscan2G3X952 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Zkscan2G3X952 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Zkscan2G3X952 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Zkscan2G3X952 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Zkscan2G3X952 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Zkscan2G3X952 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Zkscan2G3X952 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Zkscan2G3X952 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Zkscan2G3X952 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Zkscan2G3X952 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Zkscan2G3X952 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Zkscan2G3X952 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Zkscan2G3X952 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 114.5 ms