Protein–RNA interactions for Protein: G3X939

Slc9a3, Sodium/hydrogen exchanger 3, mousemouse

Predictions only

Length 829 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc9a3G3X939 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc9a3G3X939 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc9a3G3X939 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc9a3G3X939 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc9a3G3X939 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc9a3G3X939 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc9a3G3X939 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc9a3G3X939 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc9a3G3X939 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc9a3G3X939 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc9a3G3X939 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc9a3G3X939 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc9a3G3X939 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc9a3G3X939 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc9a3G3X939 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc9a3G3X939 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc9a3G3X939 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc9a3G3X939 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Slc9a3G3X939 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Slc9a3G3X939 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Slc9a3G3X939 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc9a3G3X939 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc9a3G3X939 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc9a3G3X939 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc9a3G3X939 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc9a3G3X939 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc9a3G3X939 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc9a3G3X939 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc9a3G3X939 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc9a3G3X939 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc9a3G3X939 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc9a3G3X939 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc9a3G3X939 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc9a3G3X939 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc9a3G3X939 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc9a3G3X939 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc9a3G3X939 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc9a3G3X939 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc9a3G3X939 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc9a3G3X939 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc9a3G3X939 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc9a3G3X939 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc9a3G3X939 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc9a3G3X939 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc9a3G3X939 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc9a3G3X939 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc9a3G3X939 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc9a3G3X939 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Slc9a3G3X939 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc9a3G3X939 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc9a3G3X939 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc9a3G3X939 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc9a3G3X939 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc9a3G3X939 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc9a3G3X939 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc9a3G3X939 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc9a3G3X939 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc9a3G3X939 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc9a3G3X939 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc9a3G3X939 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc9a3G3X939 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc9a3G3X939 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc9a3G3X939 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc9a3G3X939 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc9a3G3X939 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc9a3G3X939 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc9a3G3X939 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc9a3G3X939 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc9a3G3X939 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc9a3G3X939 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc9a3G3X939 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc9a3G3X939 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc9a3G3X939 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc9a3G3X939 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc9a3G3X939 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc9a3G3X939 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc9a3G3X939 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc9a3G3X939 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc9a3G3X939 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc9a3G3X939 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc9a3G3X939 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc9a3G3X939 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc9a3G3X939 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc9a3G3X939 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc9a3G3X939 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc9a3G3X939 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc9a3G3X939 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc9a3G3X939 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc9a3G3X939 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc9a3G3X939 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc9a3G3X939 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc9a3G3X939 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc9a3G3X939 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc9a3G3X939 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc9a3G3X939 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc9a3G3X939 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc9a3G3X939 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Slc9a3G3X939 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slc9a3G3X939 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Slc9a3G3X939 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms