Protein–RNA interactions for Protein: G3X8Y1

Trim55, MCG19772, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim55G3X8Y1 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trim55G3X8Y1 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trim55G3X8Y1 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trim55G3X8Y1 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trim55G3X8Y1 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trim55G3X8Y1 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trim55G3X8Y1 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trim55G3X8Y1 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trim55G3X8Y1 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trim55G3X8Y1 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trim55G3X8Y1 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim55G3X8Y1 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim55G3X8Y1 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim55G3X8Y1 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim55G3X8Y1 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim55G3X8Y1 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trim55G3X8Y1 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trim55G3X8Y1 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trim55G3X8Y1 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim55G3X8Y1 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim55G3X8Y1 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim55G3X8Y1 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim55G3X8Y1 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trim55G3X8Y1 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trim55G3X8Y1 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trim55G3X8Y1 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trim55G3X8Y1 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim55G3X8Y1 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim55G3X8Y1 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim55G3X8Y1 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim55G3X8Y1 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim55G3X8Y1 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim55G3X8Y1 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim55G3X8Y1 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim55G3X8Y1 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim55G3X8Y1 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim55G3X8Y1 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim55G3X8Y1 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim55G3X8Y1 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim55G3X8Y1 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Trim55G3X8Y1 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trim55G3X8Y1 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trim55G3X8Y1 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trim55G3X8Y1 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trim55G3X8Y1 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim55G3X8Y1 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim55G3X8Y1 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim55G3X8Y1 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim55G3X8Y1 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim55G3X8Y1 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim55G3X8Y1 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim55G3X8Y1 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim55G3X8Y1 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trim55G3X8Y1 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trim55G3X8Y1 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trim55G3X8Y1 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trim55G3X8Y1 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trim55G3X8Y1 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trim55G3X8Y1 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trim55G3X8Y1 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trim55G3X8Y1 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim55G3X8Y1 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim55G3X8Y1 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim55G3X8Y1 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim55G3X8Y1 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim55G3X8Y1 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim55G3X8Y1 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim55G3X8Y1 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim55G3X8Y1 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim55G3X8Y1 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim55G3X8Y1 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim55G3X8Y1 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim55G3X8Y1 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trim55G3X8Y1 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trim55G3X8Y1 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trim55G3X8Y1 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trim55G3X8Y1 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trim55G3X8Y1 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trim55G3X8Y1 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trim55G3X8Y1 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trim55G3X8Y1 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trim55G3X8Y1 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim55G3X8Y1 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim55G3X8Y1 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim55G3X8Y1 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim55G3X8Y1 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim55G3X8Y1 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trim55G3X8Y1 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trim55G3X8Y1 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trim55G3X8Y1 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim55G3X8Y1 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim55G3X8Y1 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim55G3X8Y1 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim55G3X8Y1 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim55G3X8Y1 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim55G3X8Y1 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim55G3X8Y1 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim55G3X8Y1 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim55G3X8Y1 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim55G3X8Y1 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms