Protein–RNA interactions for Protein: G3UW59

Ubap1l, MCG16443, mousemouse

Predictions only

Length 384 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubap1lG3UW59 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Ubap1lG3UW59 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Ubap1lG3UW59 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Ubap1lG3UW59 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Ubap1lG3UW59 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Ubap1lG3UW59 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Ubap1lG3UW59 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Ubap1lG3UW59 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Ubap1lG3UW59 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Ubap1lG3UW59 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Ubap1lG3UW59 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Ubap1lG3UW59 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Ubap1lG3UW59 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Ubap1lG3UW59 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Ubap1lG3UW59 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Ubap1lG3UW59 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Ubap1lG3UW59 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Ubap1lG3UW59 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Ubap1lG3UW59 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Ubap1lG3UW59 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Ubap1lG3UW59 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Ubap1lG3UW59 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Ubap1lG3UW59 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Ubap1lG3UW59 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Ubap1lG3UW59 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Ubap1lG3UW59 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Ubap1lG3UW59 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Ubap1lG3UW59 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Ubap1lG3UW59 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Ubap1lG3UW59 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
Ubap1lG3UW59 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Ubap1lG3UW59 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Ubap1lG3UW59 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Ubap1lG3UW59 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Ubap1lG3UW59 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Ubap1lG3UW59 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Ubap1lG3UW59 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Ubap1lG3UW59 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Ubap1lG3UW59 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Ubap1lG3UW59 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
Ubap1lG3UW59 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Ubap1lG3UW59 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Ubap1lG3UW59 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Ubap1lG3UW59 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Ubap1lG3UW59 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Ubap1lG3UW59 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Ubap1lG3UW59 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Ubap1lG3UW59 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Ubap1lG3UW59 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Ubap1lG3UW59 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Ubap1lG3UW59 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Ubap1lG3UW59 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Ubap1lG3UW59 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Ubap1lG3UW59 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Ubap1lG3UW59 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
Ubap1lG3UW59 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Ubap1lG3UW59 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Ubap1lG3UW59 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Ubap1lG3UW59 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Ubap1lG3UW59 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Ubap1lG3UW59 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Ubap1lG3UW59 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Ubap1lG3UW59 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Ubap1lG3UW59 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Ubap1lG3UW59 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Ubap1lG3UW59 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Ubap1lG3UW59 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
Ubap1lG3UW59 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Ubap1lG3UW59 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Ubap1lG3UW59 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Ubap1lG3UW59 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Ubap1lG3UW59 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Ubap1lG3UW59 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Ubap1lG3UW59 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
Ubap1lG3UW59 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Ubap1lG3UW59 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Ubap1lG3UW59 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Ubap1lG3UW59 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Ubap1lG3UW59 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Ubap1lG3UW59 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Ubap1lG3UW59 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Ubap1lG3UW59 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Ubap1lG3UW59 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Ubap1lG3UW59 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Ubap1lG3UW59 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
Ubap1lG3UW59 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Ubap1lG3UW59 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Ubap1lG3UW59 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Ubap1lG3UW59 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Ubap1lG3UW59 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Ubap1lG3UW59 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Ubap1lG3UW59 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Ubap1lG3UW59 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Ubap1lG3UW59 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
Ubap1lG3UW59 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
Ubap1lG3UW59 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Ubap1lG3UW59 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Ubap1lG3UW59 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Ubap1lG3UW59 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Ubap1lG3UW59 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 125.3 ms