Protein–RNA interactions for Protein: F8VQK7

Gm16519, Predicted gene, 16519, mousemouse

Predictions only

Length 162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm16519F8VQK7 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm16519F8VQK7 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm16519F8VQK7 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm16519F8VQK7 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm16519F8VQK7 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm16519F8VQK7 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm16519F8VQK7 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm16519F8VQK7 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm16519F8VQK7 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm16519F8VQK7 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm16519F8VQK7 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm16519F8VQK7 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm16519F8VQK7 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm16519F8VQK7 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm16519F8VQK7 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm16519F8VQK7 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm16519F8VQK7 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm16519F8VQK7 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm16519F8VQK7 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm16519F8VQK7 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm16519F8VQK7 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm16519F8VQK7 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm16519F8VQK7 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm16519F8VQK7 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm16519F8VQK7 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm16519F8VQK7 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm16519F8VQK7 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm16519F8VQK7 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm16519F8VQK7 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm16519F8VQK7 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm16519F8VQK7 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm16519F8VQK7 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm16519F8VQK7 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm16519F8VQK7 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm16519F8VQK7 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm16519F8VQK7 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm16519F8VQK7 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm16519F8VQK7 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm16519F8VQK7 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm16519F8VQK7 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm16519F8VQK7 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm16519F8VQK7 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm16519F8VQK7 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm16519F8VQK7 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm16519F8VQK7 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm16519F8VQK7 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm16519F8VQK7 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm16519F8VQK7 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm16519F8VQK7 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm16519F8VQK7 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm16519F8VQK7 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm16519F8VQK7 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm16519F8VQK7 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm16519F8VQK7 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm16519F8VQK7 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm16519F8VQK7 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm16519F8VQK7 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm16519F8VQK7 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm16519F8VQK7 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm16519F8VQK7 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm16519F8VQK7 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm16519F8VQK7 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm16519F8VQK7 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm16519F8VQK7 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm16519F8VQK7 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm16519F8VQK7 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm16519F8VQK7 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm16519F8VQK7 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm16519F8VQK7 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm16519F8VQK7 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm16519F8VQK7 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm16519F8VQK7 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm16519F8VQK7 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm16519F8VQK7 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm16519F8VQK7 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm16519F8VQK7 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm16519F8VQK7 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm16519F8VQK7 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm16519F8VQK7 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm16519F8VQK7 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm16519F8VQK7 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm16519F8VQK7 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Gm16519F8VQK7 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Gm16519F8VQK7 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm16519F8VQK7 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm16519F8VQK7 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm16519F8VQK7 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm16519F8VQK7 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm16519F8VQK7 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm16519F8VQK7 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm16519F8VQK7 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm16519F8VQK7 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm16519F8VQK7 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm16519F8VQK7 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm16519F8VQK7 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm16519F8VQK7 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm16519F8VQK7 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm16519F8VQK7 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm16519F8VQK7 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm16519F8VQK7 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms