Protein–RNA interactions for Protein: F7CD45

Gm8334, Predicted gene 8334, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8334F7CD45 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm8334F7CD45 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm8334F7CD45 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm8334F7CD45 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm8334F7CD45 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm8334F7CD45 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm8334F7CD45 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm8334F7CD45 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm8334F7CD45 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm8334F7CD45 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm8334F7CD45 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm8334F7CD45 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm8334F7CD45 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm8334F7CD45 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm8334F7CD45 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm8334F7CD45 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm8334F7CD45 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm8334F7CD45 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm8334F7CD45 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm8334F7CD45 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm8334F7CD45 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm8334F7CD45 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm8334F7CD45 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm8334F7CD45 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm8334F7CD45 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm8334F7CD45 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm8334F7CD45 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Gm8334F7CD45 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gm8334F7CD45 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gm8334F7CD45 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Gm8334F7CD45 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gm8334F7CD45 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gm8334F7CD45 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm8334F7CD45 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm8334F7CD45 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm8334F7CD45 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm8334F7CD45 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm8334F7CD45 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm8334F7CD45 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm8334F7CD45 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm8334F7CD45 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm8334F7CD45 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm8334F7CD45 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm8334F7CD45 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm8334F7CD45 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm8334F7CD45 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm8334F7CD45 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm8334F7CD45 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm8334F7CD45 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm8334F7CD45 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gm8334F7CD45 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gm8334F7CD45 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gm8334F7CD45 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
Gm8334F7CD45 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm8334F7CD45 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm8334F7CD45 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm8334F7CD45 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm8334F7CD45 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm8334F7CD45 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm8334F7CD45 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm8334F7CD45 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm8334F7CD45 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm8334F7CD45 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm8334F7CD45 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm8334F7CD45 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm8334F7CD45 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm8334F7CD45 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm8334F7CD45 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm8334F7CD45 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm8334F7CD45 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm8334F7CD45 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gm8334F7CD45 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gm8334F7CD45 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gm8334F7CD45 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm8334F7CD45 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm8334F7CD45 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm8334F7CD45 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm8334F7CD45 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm8334F7CD45 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm8334F7CD45 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm8334F7CD45 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm8334F7CD45 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm8334F7CD45 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm8334F7CD45 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm8334F7CD45 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm8334F7CD45 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm8334F7CD45 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm8334F7CD45 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm8334F7CD45 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm8334F7CD45 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm8334F7CD45 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm8334F7CD45 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm8334F7CD45 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm8334F7CD45 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm8334F7CD45 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm8334F7CD45 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm8334F7CD45 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm8334F7CD45 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm8334F7CD45 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm8334F7CD45 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.7 ms