Protein–RNA interactions for Protein: F6XQQ1

Gm10378, Predicted gene 10378 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10378F6XQQ1 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gm10378F6XQQ1 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gm10378F6XQQ1 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gm10378F6XQQ1 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gm10378F6XQQ1 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gm10378F6XQQ1 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gm10378F6XQQ1 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gm10378F6XQQ1 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gm10378F6XQQ1 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Gm10378F6XQQ1 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gm10378F6XQQ1 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gm10378F6XQQ1 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gm10378F6XQQ1 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gm10378F6XQQ1 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gm10378F6XQQ1 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gm10378F6XQQ1 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gm10378F6XQQ1 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gm10378F6XQQ1 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gm10378F6XQQ1 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gm10378F6XQQ1 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gm10378F6XQQ1 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gm10378F6XQQ1 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gm10378F6XQQ1 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gm10378F6XQQ1 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gm10378F6XQQ1 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gm10378F6XQQ1 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gm10378F6XQQ1 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gm10378F6XQQ1 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gm10378F6XQQ1 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gm10378F6XQQ1 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gm10378F6XQQ1 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gm10378F6XQQ1 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gm10378F6XQQ1 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gm10378F6XQQ1 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gm10378F6XQQ1 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gm10378F6XQQ1 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gm10378F6XQQ1 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Gm10378F6XQQ1 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gm10378F6XQQ1 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gm10378F6XQQ1 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gm10378F6XQQ1 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gm10378F6XQQ1 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gm10378F6XQQ1 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gm10378F6XQQ1 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gm10378F6XQQ1 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gm10378F6XQQ1 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Gm10378F6XQQ1 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gm10378F6XQQ1 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gm10378F6XQQ1 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gm10378F6XQQ1 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gm10378F6XQQ1 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gm10378F6XQQ1 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gm10378F6XQQ1 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gm10378F6XQQ1 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gm10378F6XQQ1 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gm10378F6XQQ1 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gm10378F6XQQ1 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gm10378F6XQQ1 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gm10378F6XQQ1 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gm10378F6XQQ1 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gm10378F6XQQ1 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gm10378F6XQQ1 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Gm10378F6XQQ1 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Gm10378F6XQQ1 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gm10378F6XQQ1 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gm10378F6XQQ1 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gm10378F6XQQ1 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gm10378F6XQQ1 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gm10378F6XQQ1 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gm10378F6XQQ1 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gm10378F6XQQ1 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gm10378F6XQQ1 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gm10378F6XQQ1 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gm10378F6XQQ1 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gm10378F6XQQ1 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gm10378F6XQQ1 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gm10378F6XQQ1 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gm10378F6XQQ1 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Gm10378F6XQQ1 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Gm10378F6XQQ1 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Gm10378F6XQQ1 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Gm10378F6XQQ1 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Gm10378F6XQQ1 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gm10378F6XQQ1 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gm10378F6XQQ1 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gm10378F6XQQ1 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gm10378F6XQQ1 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gm10378F6XQQ1 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gm10378F6XQQ1 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gm10378F6XQQ1 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gm10378F6XQQ1 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gm10378F6XQQ1 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gm10378F6XQQ1 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gm10378F6XQQ1 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gm10378F6XQQ1 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Gm10378F6XQQ1 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gm10378F6XQQ1 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gm10378F6XQQ1 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gm10378F6XQQ1 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gm10378F6XQQ1 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
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