Protein–RNA interactions for Protein: F6XDR3

Gm10542, Predicted gene 10542, mousemouse

Predictions only

Length 90 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10542F6XDR3 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm10542F6XDR3 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm10542F6XDR3 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm10542F6XDR3 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm10542F6XDR3 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm10542F6XDR3 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm10542F6XDR3 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm10542F6XDR3 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm10542F6XDR3 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm10542F6XDR3 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm10542F6XDR3 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm10542F6XDR3 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm10542F6XDR3 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm10542F6XDR3 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm10542F6XDR3 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm10542F6XDR3 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm10542F6XDR3 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm10542F6XDR3 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm10542F6XDR3 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm10542F6XDR3 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm10542F6XDR3 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm10542F6XDR3 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm10542F6XDR3 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm10542F6XDR3 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm10542F6XDR3 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm10542F6XDR3 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm10542F6XDR3 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm10542F6XDR3 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm10542F6XDR3 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm10542F6XDR3 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm10542F6XDR3 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm10542F6XDR3 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm10542F6XDR3 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm10542F6XDR3 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm10542F6XDR3 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm10542F6XDR3 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm10542F6XDR3 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm10542F6XDR3 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm10542F6XDR3 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm10542F6XDR3 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm10542F6XDR3 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm10542F6XDR3 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm10542F6XDR3 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm10542F6XDR3 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm10542F6XDR3 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm10542F6XDR3 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm10542F6XDR3 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm10542F6XDR3 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm10542F6XDR3 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm10542F6XDR3 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm10542F6XDR3 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm10542F6XDR3 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm10542F6XDR3 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm10542F6XDR3 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm10542F6XDR3 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm10542F6XDR3 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm10542F6XDR3 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm10542F6XDR3 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm10542F6XDR3 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm10542F6XDR3 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm10542F6XDR3 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm10542F6XDR3 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm10542F6XDR3 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm10542F6XDR3 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm10542F6XDR3 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm10542F6XDR3 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm10542F6XDR3 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm10542F6XDR3 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm10542F6XDR3 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm10542F6XDR3 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm10542F6XDR3 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm10542F6XDR3 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm10542F6XDR3 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm10542F6XDR3 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm10542F6XDR3 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm10542F6XDR3 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm10542F6XDR3 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm10542F6XDR3 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm10542F6XDR3 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm10542F6XDR3 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm10542F6XDR3 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm10542F6XDR3 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm10542F6XDR3 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm10542F6XDR3 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm10542F6XDR3 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm10542F6XDR3 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm10542F6XDR3 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm10542F6XDR3 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm10542F6XDR3 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm10542F6XDR3 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm10542F6XDR3 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm10542F6XDR3 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm10542F6XDR3 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm10542F6XDR3 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm10542F6XDR3 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm10542F6XDR3 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm10542F6XDR3 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm10542F6XDR3 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm10542F6XDR3 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm10542F6XDR3 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms