Protein–RNA interactions for Protein: F6RGI3

Gm340, Predicted gene 340, mousemouse

Predictions only

Length 1,242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm340F6RGI3 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm340F6RGI3 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm340F6RGI3 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm340F6RGI3 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm340F6RGI3 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm340F6RGI3 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm340F6RGI3 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm340F6RGI3 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm340F6RGI3 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm340F6RGI3 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm340F6RGI3 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm340F6RGI3 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm340F6RGI3 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm340F6RGI3 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm340F6RGI3 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm340F6RGI3 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm340F6RGI3 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm340F6RGI3 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm340F6RGI3 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm340F6RGI3 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm340F6RGI3 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm340F6RGI3 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm340F6RGI3 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm340F6RGI3 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm340F6RGI3 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm340F6RGI3 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm340F6RGI3 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm340F6RGI3 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm340F6RGI3 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm340F6RGI3 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm340F6RGI3 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm340F6RGI3 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm340F6RGI3 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm340F6RGI3 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm340F6RGI3 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm340F6RGI3 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm340F6RGI3 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm340F6RGI3 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm340F6RGI3 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm340F6RGI3 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm340F6RGI3 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm340F6RGI3 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm340F6RGI3 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm340F6RGI3 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm340F6RGI3 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm340F6RGI3 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm340F6RGI3 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm340F6RGI3 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm340F6RGI3 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm340F6RGI3 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm340F6RGI3 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm340F6RGI3 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm340F6RGI3 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm340F6RGI3 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm340F6RGI3 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm340F6RGI3 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm340F6RGI3 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm340F6RGI3 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm340F6RGI3 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm340F6RGI3 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm340F6RGI3 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm340F6RGI3 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm340F6RGI3 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm340F6RGI3 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm340F6RGI3 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm340F6RGI3 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm340F6RGI3 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm340F6RGI3 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm340F6RGI3 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm340F6RGI3 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm340F6RGI3 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm340F6RGI3 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm340F6RGI3 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm340F6RGI3 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm340F6RGI3 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm340F6RGI3 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm340F6RGI3 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm340F6RGI3 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm340F6RGI3 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm340F6RGI3 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm340F6RGI3 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm340F6RGI3 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm340F6RGI3 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm340F6RGI3 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm340F6RGI3 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm340F6RGI3 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm340F6RGI3 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm340F6RGI3 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm340F6RGI3 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm340F6RGI3 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm340F6RGI3 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm340F6RGI3 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm340F6RGI3 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm340F6RGI3 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm340F6RGI3 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm340F6RGI3 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm340F6RGI3 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm340F6RGI3 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm340F6RGI3 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm340F6RGI3 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 148.4 ms