Protein–RNA interactions for Protein: F6RFI0

Gm9887, Predicted gene 9887, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9887F6RFI0 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm9887F6RFI0 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm9887F6RFI0 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm9887F6RFI0 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm9887F6RFI0 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm9887F6RFI0 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm9887F6RFI0 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm9887F6RFI0 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Gm9887F6RFI0 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm9887F6RFI0 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm9887F6RFI0 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Gm9887F6RFI0 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm9887F6RFI0 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm9887F6RFI0 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm9887F6RFI0 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm9887F6RFI0 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Gm9887F6RFI0 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm9887F6RFI0 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm9887F6RFI0 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm9887F6RFI0 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm9887F6RFI0 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm9887F6RFI0 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gm9887F6RFI0 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Gm9887F6RFI0 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm9887F6RFI0 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm9887F6RFI0 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm9887F6RFI0 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm9887F6RFI0 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm9887F6RFI0 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm9887F6RFI0 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm9887F6RFI0 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm9887F6RFI0 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Gm9887F6RFI0 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm9887F6RFI0 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Gm9887F6RFI0 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm9887F6RFI0 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm9887F6RFI0 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Gm9887F6RFI0 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm9887F6RFI0 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm9887F6RFI0 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm9887F6RFI0 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Gm9887F6RFI0 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm9887F6RFI0 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm9887F6RFI0 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm9887F6RFI0 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm9887F6RFI0 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm9887F6RFI0 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm9887F6RFI0 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm9887F6RFI0 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm9887F6RFI0 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm9887F6RFI0 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm9887F6RFI0 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm9887F6RFI0 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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