Protein–RNA interactions for Protein: F6Q785

Gm29094, Predicted gene 29094 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm29094F6Q785 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Gm29094F6Q785 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Gm29094F6Q785 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Gm29094F6Q785 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Gm29094F6Q785 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Gm29094F6Q785 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Gm29094F6Q785 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Gm29094F6Q785 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Gm29094F6Q785 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Gm29094F6Q785 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Gm29094F6Q785 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Gm29094F6Q785 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Gm29094F6Q785 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Gm29094F6Q785 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Gm29094F6Q785 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Gm29094F6Q785 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Gm29094F6Q785 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Gm29094F6Q785 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Gm29094F6Q785 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Gm29094F6Q785 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Gm29094F6Q785 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Gm29094F6Q785 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Gm29094F6Q785 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Gm29094F6Q785 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Gm29094F6Q785 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Gm29094F6Q785 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Gm29094F6Q785 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Gm29094F6Q785 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Gm29094F6Q785 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Gm29094F6Q785 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Gm29094F6Q785 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Gm29094F6Q785 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Gm29094F6Q785 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Gm29094F6Q785 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Gm29094F6Q785 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Gm29094F6Q785 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Gm29094F6Q785 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Gm29094F6Q785 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Gm29094F6Q785 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Gm29094F6Q785 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Gm29094F6Q785 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Gm29094F6Q785 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Gm29094F6Q785 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Gm29094F6Q785 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Gm29094F6Q785 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Gm29094F6Q785 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Gm29094F6Q785 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Gm29094F6Q785 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Gm29094F6Q785 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Gm29094F6Q785 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Gm29094F6Q785 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Gm29094F6Q785 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Gm29094F6Q785 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Gm29094F6Q785 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Gm29094F6Q785 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Gm29094F6Q785 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Gm29094F6Q785 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Gm29094F6Q785 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Gm29094F6Q785 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Gm29094F6Q785 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Gm29094F6Q785 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Gm29094F6Q785 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Gm29094F6Q785 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Gm29094F6Q785 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Gm29094F6Q785 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Gm29094F6Q785 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Gm29094F6Q785 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Gm29094F6Q785 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Gm29094F6Q785 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Gm29094F6Q785 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Gm29094F6Q785 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Gm29094F6Q785 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Gm29094F6Q785 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Gm29094F6Q785 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Gm29094F6Q785 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Gm29094F6Q785 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Gm29094F6Q785 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Gm29094F6Q785 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Gm29094F6Q785 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Gm29094F6Q785 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Gm29094F6Q785 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Gm29094F6Q785 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Gm29094F6Q785 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Gm29094F6Q785 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Gm29094F6Q785 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Gm29094F6Q785 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Gm29094F6Q785 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Gm29094F6Q785 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Gm29094F6Q785 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Gm29094F6Q785 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Gm29094F6Q785 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Gm29094F6Q785 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Gm29094F6Q785 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Gm29094F6Q785 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Gm29094F6Q785 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Gm29094F6Q785 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Gm29094F6Q785 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Gm29094F6Q785 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Gm29094F6Q785 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Gm29094F6Q785 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms