Protein–RNA interactions for Protein: E9QAU8

Rnf165, E3 ubiquitin-protein ligase RNF165, mousemouse

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf165E9QAU8 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rnf165E9QAU8 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rnf165E9QAU8 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rnf165E9QAU8 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rnf165E9QAU8 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rnf165E9QAU8 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rnf165E9QAU8 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Rnf165E9QAU8 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rnf165E9QAU8 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rnf165E9QAU8 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Rnf165E9QAU8 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rnf165E9QAU8 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rnf165E9QAU8 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Rnf165E9QAU8 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rnf165E9QAU8 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rnf165E9QAU8 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rnf165E9QAU8 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rnf165E9QAU8 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rnf165E9QAU8 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rnf165E9QAU8 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rnf165E9QAU8 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rnf165E9QAU8 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rnf165E9QAU8 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rnf165E9QAU8 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rnf165E9QAU8 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rnf165E9QAU8 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rnf165E9QAU8 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rnf165E9QAU8 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Rnf165E9QAU8 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rnf165E9QAU8 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Rnf165E9QAU8 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rnf165E9QAU8 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rnf165E9QAU8 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rnf165E9QAU8 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rnf165E9QAU8 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Rnf165E9QAU8 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rnf165E9QAU8 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rnf165E9QAU8 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Rnf165E9QAU8 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rnf165E9QAU8 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rnf165E9QAU8 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Rnf165E9QAU8 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Rnf165E9QAU8 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rnf165E9QAU8 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rnf165E9QAU8 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rnf165E9QAU8 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rnf165E9QAU8 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rnf165E9QAU8 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rnf165E9QAU8 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rnf165E9QAU8 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Rnf165E9QAU8 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rnf165E9QAU8 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rnf165E9QAU8 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rnf165E9QAU8 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rnf165E9QAU8 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rnf165E9QAU8 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rnf165E9QAU8 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rnf165E9QAU8 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rnf165E9QAU8 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rnf165E9QAU8 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rnf165E9QAU8 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rnf165E9QAU8 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rnf165E9QAU8 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Rnf165E9QAU8 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rnf165E9QAU8 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
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Rnf165E9QAU8 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rnf165E9QAU8 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Rnf165E9QAU8 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
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Rnf165E9QAU8 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rnf165E9QAU8 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rnf165E9QAU8 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rnf165E9QAU8 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Rnf165E9QAU8 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rnf165E9QAU8 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rnf165E9QAU8 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Rnf165E9QAU8 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rnf165E9QAU8 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rnf165E9QAU8 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rnf165E9QAU8 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rnf165E9QAU8 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rnf165E9QAU8 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rnf165E9QAU8 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Rnf165E9QAU8 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Rnf165E9QAU8 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rnf165E9QAU8 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rnf165E9QAU8 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rnf165E9QAU8 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rnf165E9QAU8 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rnf165E9QAU8 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rnf165E9QAU8 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Rnf165E9QAU8 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rnf165E9QAU8 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rnf165E9QAU8 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rnf165E9QAU8 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rnf165E9QAU8 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rnf165E9QAU8 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rnf165E9QAU8 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rnf165E9QAU8 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
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