Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7Q1

Gm5407, Predicted gene 5407, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5407E9Q7Q1 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Gm5407E9Q7Q1 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gm5407E9Q7Q1 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gm5407E9Q7Q1 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gm5407E9Q7Q1 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gm5407E9Q7Q1 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gm5407E9Q7Q1 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gm5407E9Q7Q1 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gm5407E9Q7Q1 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gm5407E9Q7Q1 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gm5407E9Q7Q1 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Gm5407E9Q7Q1 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gm5407E9Q7Q1 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Gm5407E9Q7Q1 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gm5407E9Q7Q1 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gm5407E9Q7Q1 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gm5407E9Q7Q1 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gm5407E9Q7Q1 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gm5407E9Q7Q1 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gm5407E9Q7Q1 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gm5407E9Q7Q1 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gm5407E9Q7Q1 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gm5407E9Q7Q1 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gm5407E9Q7Q1 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gm5407E9Q7Q1 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Gm5407E9Q7Q1 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Gm5407E9Q7Q1 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gm5407E9Q7Q1 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Gm5407E9Q7Q1 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gm5407E9Q7Q1 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gm5407E9Q7Q1 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm5407E9Q7Q1 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm5407E9Q7Q1 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm5407E9Q7Q1 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm5407E9Q7Q1 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm5407E9Q7Q1 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm5407E9Q7Q1 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm5407E9Q7Q1 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm5407E9Q7Q1 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm5407E9Q7Q1 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm5407E9Q7Q1 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm5407E9Q7Q1 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gm5407E9Q7Q1 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gm5407E9Q7Q1 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gm5407E9Q7Q1 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gm5407E9Q7Q1 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gm5407E9Q7Q1 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gm5407E9Q7Q1 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gm5407E9Q7Q1 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gm5407E9Q7Q1 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gm5407E9Q7Q1 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm5407E9Q7Q1 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm5407E9Q7Q1 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm5407E9Q7Q1 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm5407E9Q7Q1 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm5407E9Q7Q1 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm5407E9Q7Q1 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm5407E9Q7Q1 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm5407E9Q7Q1 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm5407E9Q7Q1 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm5407E9Q7Q1 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm5407E9Q7Q1 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm5407E9Q7Q1 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm5407E9Q7Q1 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm5407E9Q7Q1 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm5407E9Q7Q1 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm5407E9Q7Q1 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm5407E9Q7Q1 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm5407E9Q7Q1 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm5407E9Q7Q1 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm5407E9Q7Q1 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm5407E9Q7Q1 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm5407E9Q7Q1 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm5407E9Q7Q1 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm5407E9Q7Q1 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm5407E9Q7Q1 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm5407E9Q7Q1 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm5407E9Q7Q1 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm5407E9Q7Q1 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm5407E9Q7Q1 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm5407E9Q7Q1 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm5407E9Q7Q1 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm5407E9Q7Q1 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm5407E9Q7Q1 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm5407E9Q7Q1 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm5407E9Q7Q1 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm5407E9Q7Q1 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm5407E9Q7Q1 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm5407E9Q7Q1 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm5407E9Q7Q1 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm5407E9Q7Q1 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm5407E9Q7Q1 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm5407E9Q7Q1 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm5407E9Q7Q1 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm5407E9Q7Q1 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm5407E9Q7Q1 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm5407E9Q7Q1 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm5407E9Q7Q1 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm5407E9Q7Q1 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm5407E9Q7Q1 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.5 ms