Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7P1

Col22a1, Collagen, type XXII, alpha 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col22a1E9Q7P1 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Col22a1E9Q7P1 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Col22a1E9Q7P1 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Col22a1E9Q7P1 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Col22a1E9Q7P1 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Col22a1E9Q7P1 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Col22a1E9Q7P1 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Col22a1E9Q7P1 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
Col22a1E9Q7P1 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
Col22a1E9Q7P1 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Col22a1E9Q7P1 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
Col22a1E9Q7P1 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.37
Col22a1E9Q7P1 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
Col22a1E9Q7P1 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Col22a1E9Q7P1 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Col22a1E9Q7P1 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Col22a1E9Q7P1 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Col22a1E9Q7P1 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Col22a1E9Q7P1 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Col22a1E9Q7P1 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Col22a1E9Q7P1 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
Col22a1E9Q7P1 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
Col22a1E9Q7P1 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Col22a1E9Q7P1 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Col22a1E9Q7P1 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Col22a1E9Q7P1 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Col22a1E9Q7P1 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Col22a1E9Q7P1 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Col22a1E9Q7P1 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Col22a1E9Q7P1 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Col22a1E9Q7P1 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Col22a1E9Q7P1 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Col22a1E9Q7P1 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Col22a1E9Q7P1 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Col22a1E9Q7P1 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Col22a1E9Q7P1 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Col22a1E9Q7P1 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Col22a1E9Q7P1 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Col22a1E9Q7P1 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Col22a1E9Q7P1 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Col22a1E9Q7P1 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
Col22a1E9Q7P1 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Col22a1E9Q7P1 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Col22a1E9Q7P1 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Col22a1E9Q7P1 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Col22a1E9Q7P1 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Col22a1E9Q7P1 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Col22a1E9Q7P1 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Col22a1E9Q7P1 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Col22a1E9Q7P1 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Col22a1E9Q7P1 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Col22a1E9Q7P1 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Col22a1E9Q7P1 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Col22a1E9Q7P1 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Col22a1E9Q7P1 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
Col22a1E9Q7P1 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Col22a1E9Q7P1 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Col22a1E9Q7P1 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Col22a1E9Q7P1 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Col22a1E9Q7P1 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Col22a1E9Q7P1 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Col22a1E9Q7P1 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Col22a1E9Q7P1 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
Col22a1E9Q7P1 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Col22a1E9Q7P1 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Col22a1E9Q7P1 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Col22a1E9Q7P1 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Col22a1E9Q7P1 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Col22a1E9Q7P1 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
Col22a1E9Q7P1 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Col22a1E9Q7P1 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Col22a1E9Q7P1 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Col22a1E9Q7P1 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Col22a1E9Q7P1 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Col22a1E9Q7P1 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Col22a1E9Q7P1 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Col22a1E9Q7P1 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Col22a1E9Q7P1 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Col22a1E9Q7P1 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Col22a1E9Q7P1 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Col22a1E9Q7P1 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Col22a1E9Q7P1 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Col22a1E9Q7P1 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Col22a1E9Q7P1 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Col22a1E9Q7P1 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Col22a1E9Q7P1 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Col22a1E9Q7P1 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Col22a1E9Q7P1 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Col22a1E9Q7P1 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
Col22a1E9Q7P1 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Col22a1E9Q7P1 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Col22a1E9Q7P1 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Col22a1E9Q7P1 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Col22a1E9Q7P1 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Col22a1E9Q7P1 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Col22a1E9Q7P1 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Col22a1E9Q7P1 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Col22a1E9Q7P1 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Col22a1E9Q7P1 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Col22a1E9Q7P1 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms