Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6D7

1700024B05Rik, RIKEN cDNA 1700024B05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700024B05RikE9Q6D7 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
1700024B05RikE9Q6D7 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
1700024B05RikE9Q6D7 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
1700024B05RikE9Q6D7 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
1700024B05RikE9Q6D7 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
1700024B05RikE9Q6D7 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
1700024B05RikE9Q6D7 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
1700024B05RikE9Q6D7 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
1700024B05RikE9Q6D7 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
1700024B05RikE9Q6D7 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
1700024B05RikE9Q6D7 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
1700024B05RikE9Q6D7 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
1700024B05RikE9Q6D7 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
1700024B05RikE9Q6D7 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
1700024B05RikE9Q6D7 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
1700024B05RikE9Q6D7 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
1700024B05RikE9Q6D7 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
1700024B05RikE9Q6D7 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
1700024B05RikE9Q6D7 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
1700024B05RikE9Q6D7 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
1700024B05RikE9Q6D7 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
1700024B05RikE9Q6D7 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
1700024B05RikE9Q6D7 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
1700024B05RikE9Q6D7 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
1700024B05RikE9Q6D7 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
1700024B05RikE9Q6D7 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
1700024B05RikE9Q6D7 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
1700024B05RikE9Q6D7 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
1700024B05RikE9Q6D7 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
1700024B05RikE9Q6D7 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
1700024B05RikE9Q6D7 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
1700024B05RikE9Q6D7 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
1700024B05RikE9Q6D7 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
1700024B05RikE9Q6D7 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
1700024B05RikE9Q6D7 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
1700024B05RikE9Q6D7 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
1700024B05RikE9Q6D7 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
1700024B05RikE9Q6D7 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
1700024B05RikE9Q6D7 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
1700024B05RikE9Q6D7 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
1700024B05RikE9Q6D7 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
1700024B05RikE9Q6D7 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
1700024B05RikE9Q6D7 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
1700024B05RikE9Q6D7 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
1700024B05RikE9Q6D7 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
1700024B05RikE9Q6D7 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
1700024B05RikE9Q6D7 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
1700024B05RikE9Q6D7 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
1700024B05RikE9Q6D7 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
1700024B05RikE9Q6D7 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
1700024B05RikE9Q6D7 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
1700024B05RikE9Q6D7 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
1700024B05RikE9Q6D7 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
1700024B05RikE9Q6D7 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
1700024B05RikE9Q6D7 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
1700024B05RikE9Q6D7 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
1700024B05RikE9Q6D7 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
1700024B05RikE9Q6D7 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
1700024B05RikE9Q6D7 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
1700024B05RikE9Q6D7 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
1700024B05RikE9Q6D7 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
1700024B05RikE9Q6D7 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
1700024B05RikE9Q6D7 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
1700024B05RikE9Q6D7 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
1700024B05RikE9Q6D7 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
1700024B05RikE9Q6D7 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
1700024B05RikE9Q6D7 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
1700024B05RikE9Q6D7 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
1700024B05RikE9Q6D7 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
1700024B05RikE9Q6D7 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
1700024B05RikE9Q6D7 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
1700024B05RikE9Q6D7 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
1700024B05RikE9Q6D7 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
1700024B05RikE9Q6D7 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
1700024B05RikE9Q6D7 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
1700024B05RikE9Q6D7 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
1700024B05RikE9Q6D7 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
1700024B05RikE9Q6D7 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
1700024B05RikE9Q6D7 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
1700024B05RikE9Q6D7 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
1700024B05RikE9Q6D7 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
1700024B05RikE9Q6D7 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
1700024B05RikE9Q6D7 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
1700024B05RikE9Q6D7 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
1700024B05RikE9Q6D7 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
1700024B05RikE9Q6D7 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
1700024B05RikE9Q6D7 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
1700024B05RikE9Q6D7 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
1700024B05RikE9Q6D7 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
1700024B05RikE9Q6D7 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
1700024B05RikE9Q6D7 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
1700024B05RikE9Q6D7 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
1700024B05RikE9Q6D7 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
1700024B05RikE9Q6D7 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
1700024B05RikE9Q6D7 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
1700024B05RikE9Q6D7 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
1700024B05RikE9Q6D7 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
1700024B05RikE9Q6D7 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
1700024B05RikE9Q6D7 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
1700024B05RikE9Q6D7 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101.5 ms