Protein–RNA interactions for Protein: E9Q658

Pate1, Prostate and testis-expressed 1, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pate1E9Q658 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Pate1E9Q658 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pate1E9Q658 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pate1E9Q658 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pate1E9Q658 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pate1E9Q658 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pate1E9Q658 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pate1E9Q658 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pate1E9Q658 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pate1E9Q658 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pate1E9Q658 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pate1E9Q658 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pate1E9Q658 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pate1E9Q658 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pate1E9Q658 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pate1E9Q658 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pate1E9Q658 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pate1E9Q658 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pate1E9Q658 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pate1E9Q658 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pate1E9Q658 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pate1E9Q658 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pate1E9Q658 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pate1E9Q658 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pate1E9Q658 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pate1E9Q658 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pate1E9Q658 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pate1E9Q658 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pate1E9Q658 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pate1E9Q658 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pate1E9Q658 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pate1E9Q658 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pate1E9Q658 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pate1E9Q658 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Pate1E9Q658 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pate1E9Q658 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pate1E9Q658 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pate1E9Q658 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pate1E9Q658 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pate1E9Q658 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pate1E9Q658 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pate1E9Q658 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pate1E9Q658 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pate1E9Q658 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pate1E9Q658 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pate1E9Q658 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pate1E9Q658 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pate1E9Q658 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Pate1E9Q658 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pate1E9Q658 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pate1E9Q658 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pate1E9Q658 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pate1E9Q658 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pate1E9Q658 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pate1E9Q658 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pate1E9Q658 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pate1E9Q658 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pate1E9Q658 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pate1E9Q658 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pate1E9Q658 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pate1E9Q658 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pate1E9Q658 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pate1E9Q658 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pate1E9Q658 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pate1E9Q658 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pate1E9Q658 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pate1E9Q658 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pate1E9Q658 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pate1E9Q658 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pate1E9Q658 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pate1E9Q658 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pate1E9Q658 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pate1E9Q658 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Pate1E9Q658 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pate1E9Q658 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pate1E9Q658 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pate1E9Q658 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pate1E9Q658 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pate1E9Q658 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pate1E9Q658 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pate1E9Q658 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pate1E9Q658 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pate1E9Q658 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pate1E9Q658 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pate1E9Q658 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pate1E9Q658 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Pate1E9Q658 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pate1E9Q658 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pate1E9Q658 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pate1E9Q658 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pate1E9Q658 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pate1E9Q658 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pate1E9Q658 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pate1E9Q658 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pate1E9Q658 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pate1E9Q658 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Pate1E9Q658 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Pate1E9Q658 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Pate1E9Q658 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pate1E9Q658 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms