Protein–RNA interactions for Protein: E9Q649

Gcnt4, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase 4, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcnt4E9Q649 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gcnt4E9Q649 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gcnt4E9Q649 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gcnt4E9Q649 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Gcnt4E9Q649 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Gcnt4E9Q649 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gcnt4E9Q649 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
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Gcnt4E9Q649 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gcnt4E9Q649 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Gcnt4E9Q649 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gcnt4E9Q649 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
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Gcnt4E9Q649 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gcnt4E9Q649 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
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Gcnt4E9Q649 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
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Gcnt4E9Q649 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gcnt4E9Q649 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gcnt4E9Q649 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gcnt4E9Q649 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
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Gcnt4E9Q649 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gcnt4E9Q649 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gcnt4E9Q649 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gcnt4E9Q649 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gcnt4E9Q649 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gcnt4E9Q649 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gcnt4E9Q649 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gcnt4E9Q649 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
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Gcnt4E9Q649 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
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Gcnt4E9Q649 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
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Gcnt4E9Q649 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
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Gcnt4E9Q649 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gcnt4E9Q649 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gcnt4E9Q649 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gcnt4E9Q649 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gcnt4E9Q649 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
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Gcnt4E9Q649 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
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Gcnt4E9Q649 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
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Gcnt4E9Q649 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gcnt4E9Q649 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gcnt4E9Q649 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gcnt4E9Q649 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gcnt4E9Q649 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gcnt4E9Q649 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gcnt4E9Q649 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gcnt4E9Q649 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gcnt4E9Q649 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gcnt4E9Q649 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gcnt4E9Q649 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gcnt4E9Q649 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gcnt4E9Q649 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gcnt4E9Q649 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gcnt4E9Q649 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gcnt4E9Q649 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gcnt4E9Q649 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Gcnt4E9Q649 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gcnt4E9Q649 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gcnt4E9Q649 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gcnt4E9Q649 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gcnt4E9Q649 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Gcnt4E9Q649 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Gcnt4E9Q649 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
Gcnt4E9Q649 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Gcnt4E9Q649 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gcnt4E9Q649 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gcnt4E9Q649 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
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