Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5B4

Zscan29, Zinc finger SCAN domains 29, mousemouse

Predictions only

Length 869 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zscan29E9Q5B4 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Zscan29E9Q5B4 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Zscan29E9Q5B4 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Zscan29E9Q5B4 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Zscan29E9Q5B4 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Zscan29E9Q5B4 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Zscan29E9Q5B4 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Zscan29E9Q5B4 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Zscan29E9Q5B4 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Zscan29E9Q5B4 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Zscan29E9Q5B4 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Zscan29E9Q5B4 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Zscan29E9Q5B4 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Zscan29E9Q5B4 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Zscan29E9Q5B4 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Zscan29E9Q5B4 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Zscan29E9Q5B4 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Zscan29E9Q5B4 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Zscan29E9Q5B4 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Zscan29E9Q5B4 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Zscan29E9Q5B4 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Zscan29E9Q5B4 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Zscan29E9Q5B4 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Zscan29E9Q5B4 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Zscan29E9Q5B4 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Zscan29E9Q5B4 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Zscan29E9Q5B4 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Zscan29E9Q5B4 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Zscan29E9Q5B4 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Zscan29E9Q5B4 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Zscan29E9Q5B4 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Zscan29E9Q5B4 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Zscan29E9Q5B4 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Zscan29E9Q5B4 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Zscan29E9Q5B4 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Zscan29E9Q5B4 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Zscan29E9Q5B4 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Zscan29E9Q5B4 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Zscan29E9Q5B4 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Zscan29E9Q5B4 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Zscan29E9Q5B4 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Zscan29E9Q5B4 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Zscan29E9Q5B4 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Zscan29E9Q5B4 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Zscan29E9Q5B4 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Zscan29E9Q5B4 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Zscan29E9Q5B4 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Zscan29E9Q5B4 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Zscan29E9Q5B4 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Zscan29E9Q5B4 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Zscan29E9Q5B4 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Zscan29E9Q5B4 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Zscan29E9Q5B4 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Zscan29E9Q5B4 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Zscan29E9Q5B4 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Zscan29E9Q5B4 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Zscan29E9Q5B4 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Zscan29E9Q5B4 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Zscan29E9Q5B4 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Zscan29E9Q5B4 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Zscan29E9Q5B4 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Zscan29E9Q5B4 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Zscan29E9Q5B4 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Zscan29E9Q5B4 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Zscan29E9Q5B4 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Zscan29E9Q5B4 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Zscan29E9Q5B4 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Zscan29E9Q5B4 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Zscan29E9Q5B4 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Zscan29E9Q5B4 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Zscan29E9Q5B4 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Zscan29E9Q5B4 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Zscan29E9Q5B4 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Zscan29E9Q5B4 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Zscan29E9Q5B4 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Zscan29E9Q5B4 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Zscan29E9Q5B4 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Zscan29E9Q5B4 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Zscan29E9Q5B4 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Zscan29E9Q5B4 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Zscan29E9Q5B4 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Zscan29E9Q5B4 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Zscan29E9Q5B4 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Zscan29E9Q5B4 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Zscan29E9Q5B4 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Zscan29E9Q5B4 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Zscan29E9Q5B4 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Zscan29E9Q5B4 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Zscan29E9Q5B4 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Zscan29E9Q5B4 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Zscan29E9Q5B4 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Zscan29E9Q5B4 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Zscan29E9Q5B4 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Zscan29E9Q5B4 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Zscan29E9Q5B4 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Zscan29E9Q5B4 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Zscan29E9Q5B4 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Zscan29E9Q5B4 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Zscan29E9Q5B4 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Zscan29E9Q5B4 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms