Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4T4

Ccdc71l, Coiled-coil domain-containing 71-like, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71lE9Q4T4 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Ccdc71lE9Q4T4 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc71lE9Q4T4 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc71lE9Q4T4 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc71lE9Q4T4 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc71lE9Q4T4 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc71lE9Q4T4 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc71lE9Q4T4 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc71lE9Q4T4 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc71lE9Q4T4 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc71lE9Q4T4 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc71lE9Q4T4 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc71lE9Q4T4 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc71lE9Q4T4 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc71lE9Q4T4 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc71lE9Q4T4 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc71lE9Q4T4 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc71lE9Q4T4 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc71lE9Q4T4 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc71lE9Q4T4 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc71lE9Q4T4 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc71lE9Q4T4 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc71lE9Q4T4 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc71lE9Q4T4 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc71lE9Q4T4 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc71lE9Q4T4 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc71lE9Q4T4 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc71lE9Q4T4 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc71lE9Q4T4 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc71lE9Q4T4 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc71lE9Q4T4 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc71lE9Q4T4 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc71lE9Q4T4 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc71lE9Q4T4 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc71lE9Q4T4 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc71lE9Q4T4 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc71lE9Q4T4 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc71lE9Q4T4 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc71lE9Q4T4 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc71lE9Q4T4 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc71lE9Q4T4 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc71lE9Q4T4 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc71lE9Q4T4 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc71lE9Q4T4 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc71lE9Q4T4 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc71lE9Q4T4 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc71lE9Q4T4 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc71lE9Q4T4 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc71lE9Q4T4 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc71lE9Q4T4 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc71lE9Q4T4 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc71lE9Q4T4 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc71lE9Q4T4 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc71lE9Q4T4 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc71lE9Q4T4 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc71lE9Q4T4 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc71lE9Q4T4 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc71lE9Q4T4 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc71lE9Q4T4 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc71lE9Q4T4 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc71lE9Q4T4 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc71lE9Q4T4 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc71lE9Q4T4 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc71lE9Q4T4 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc71lE9Q4T4 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc71lE9Q4T4 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc71lE9Q4T4 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc71lE9Q4T4 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc71lE9Q4T4 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc71lE9Q4T4 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc71lE9Q4T4 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc71lE9Q4T4 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc71lE9Q4T4 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc71lE9Q4T4 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc71lE9Q4T4 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc71lE9Q4T4 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc71lE9Q4T4 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc71lE9Q4T4 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc71lE9Q4T4 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc71lE9Q4T4 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc71lE9Q4T4 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc71lE9Q4T4 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc71lE9Q4T4 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc71lE9Q4T4 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc71lE9Q4T4 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc71lE9Q4T4 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc71lE9Q4T4 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc71lE9Q4T4 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc71lE9Q4T4 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc71lE9Q4T4 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc71lE9Q4T4 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc71lE9Q4T4 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc71lE9Q4T4 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc71lE9Q4T4 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc71lE9Q4T4 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc71lE9Q4T4 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc71lE9Q4T4 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc71lE9Q4T4 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc71lE9Q4T4 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc71lE9Q4T4 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms