Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1W3

Neb, Nebulin, mousemouse

Predictions only

Length 7,152 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NebE9Q1W3 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
NebE9Q1W3 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
NebE9Q1W3 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
NebE9Q1W3 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
NebE9Q1W3 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
NebE9Q1W3 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
NebE9Q1W3 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
NebE9Q1W3 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
NebE9Q1W3 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
NebE9Q1W3 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
NebE9Q1W3 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
NebE9Q1W3 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
NebE9Q1W3 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
NebE9Q1W3 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
NebE9Q1W3 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
NebE9Q1W3 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
NebE9Q1W3 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
NebE9Q1W3 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
NebE9Q1W3 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
NebE9Q1W3 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC6.48□□□□□ -1.37
NebE9Q1W3 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
NebE9Q1W3 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
NebE9Q1W3 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
NebE9Q1W3 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
NebE9Q1W3 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
NebE9Q1W3 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
NebE9Q1W3 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
NebE9Q1W3 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
NebE9Q1W3 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
NebE9Q1W3 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
NebE9Q1W3 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
NebE9Q1W3 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
NebE9Q1W3 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
NebE9Q1W3 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC6.47□□□□□ -1.37
NebE9Q1W3 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC6.47□□□□□ -1.37
NebE9Q1W3 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
NebE9Q1W3 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
NebE9Q1W3 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC6.47□□□□□ -1.37
NebE9Q1W3 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
NebE9Q1W3 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
NebE9Q1W3 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
NebE9Q1W3 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
NebE9Q1W3 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
NebE9Q1W3 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
NebE9Q1W3 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
NebE9Q1W3 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
NebE9Q1W3 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
NebE9Q1W3 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC6.46□□□□□ -1.37
NebE9Q1W3 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC6.46□□□□□ -1.37
NebE9Q1W3 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC6.46□□□□□ -1.37
NebE9Q1W3 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
NebE9Q1W3 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
NebE9Q1W3 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC6.46□□□□□ -1.38
NebE9Q1W3 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
NebE9Q1W3 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
NebE9Q1W3 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
NebE9Q1W3 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
NebE9Q1W3 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
NebE9Q1W3 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
NebE9Q1W3 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
NebE9Q1W3 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
NebE9Q1W3 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
NebE9Q1W3 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
NebE9Q1W3 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
NebE9Q1W3 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
NebE9Q1W3 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
NebE9Q1W3 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
NebE9Q1W3 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
NebE9Q1W3 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
NebE9Q1W3 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
NebE9Q1W3 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
NebE9Q1W3 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
NebE9Q1W3 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
NebE9Q1W3 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
NebE9Q1W3 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
NebE9Q1W3 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
NebE9Q1W3 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
NebE9Q1W3 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
NebE9Q1W3 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
NebE9Q1W3 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
NebE9Q1W3 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
NebE9Q1W3 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
NebE9Q1W3 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
NebE9Q1W3 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
NebE9Q1W3 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
NebE9Q1W3 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
NebE9Q1W3 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
NebE9Q1W3 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
NebE9Q1W3 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
NebE9Q1W3 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
NebE9Q1W3 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
NebE9Q1W3 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
NebE9Q1W3 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
NebE9Q1W3 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
NebE9Q1W3 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
NebE9Q1W3 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
NebE9Q1W3 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
NebE9Q1W3 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
NebE9Q1W3 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
NebE9Q1W3 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC6.42□□□□□ -1.38
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