Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1F5

Myo5c, Myosin VC, mousemouse

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Length 1,742 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo5cE9Q1F5 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Myo5cE9Q1F5 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Myo5cE9Q1F5 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
Myo5cE9Q1F5 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Myo5cE9Q1F5 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Myo5cE9Q1F5 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Myo5cE9Q1F5 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Myo5cE9Q1F5 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Myo5cE9Q1F5 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.88
Myo5cE9Q1F5 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
Myo5cE9Q1F5 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
Myo5cE9Q1F5 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.87
Myo5cE9Q1F5 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Myo5cE9Q1F5 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Myo5cE9Q1F5 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Myo5cE9Q1F5 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Myo5cE9Q1F5 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC32.98■■■□□ 2.87
Myo5cE9Q1F5 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC32.97■■■□□ 2.87
Myo5cE9Q1F5 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
Myo5cE9Q1F5 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Myo5cE9Q1F5 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Myo5cE9Q1F5 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Myo5cE9Q1F5 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
Myo5cE9Q1F5 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Myo5cE9Q1F5 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
Myo5cE9Q1F5 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.87
Myo5cE9Q1F5 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Myo5cE9Q1F5 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.87
Myo5cE9Q1F5 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
Myo5cE9Q1F5 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Myo5cE9Q1F5 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
Myo5cE9Q1F5 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC32.94■■■□□ 2.86
Myo5cE9Q1F5 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Myo5cE9Q1F5 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
Myo5cE9Q1F5 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Myo5cE9Q1F5 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
Myo5cE9Q1F5 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
Myo5cE9Q1F5 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
Myo5cE9Q1F5 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Myo5cE9Q1F5 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Myo5cE9Q1F5 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Myo5cE9Q1F5 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC32.9■■■□□ 2.86
Myo5cE9Q1F5 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Myo5cE9Q1F5 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC32.89■■■□□ 2.86
Myo5cE9Q1F5 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC32.88■■■□□ 2.85
Myo5cE9Q1F5 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Myo5cE9Q1F5 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Myo5cE9Q1F5 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Myo5cE9Q1F5 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
Myo5cE9Q1F5 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Myo5cE9Q1F5 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Myo5cE9Q1F5 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Myo5cE9Q1F5 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC32.84■■■□□ 2.85
Myo5cE9Q1F5 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Myo5cE9Q1F5 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Myo5cE9Q1F5 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
Myo5cE9Q1F5 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Myo5cE9Q1F5 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.85
Myo5cE9Q1F5 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.85
Myo5cE9Q1F5 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Myo5cE9Q1F5 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Myo5cE9Q1F5 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.82■■■□□ 2.84
Myo5cE9Q1F5 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Myo5cE9Q1F5 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
Myo5cE9Q1F5 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
Myo5cE9Q1F5 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Myo5cE9Q1F5 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
Myo5cE9Q1F5 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
Myo5cE9Q1F5 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC32.79■■■□□ 2.84
Myo5cE9Q1F5 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC32.79■■■□□ 2.84
Myo5cE9Q1F5 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC32.78■■■□□ 2.84
Myo5cE9Q1F5 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Myo5cE9Q1F5 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Myo5cE9Q1F5 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Myo5cE9Q1F5 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
Myo5cE9Q1F5 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
Myo5cE9Q1F5 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC32.77■■■□□ 2.84
Myo5cE9Q1F5 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Myo5cE9Q1F5 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Myo5cE9Q1F5 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC32.77■■■□□ 2.84
Myo5cE9Q1F5 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC32.77■■■□□ 2.84
Myo5cE9Q1F5 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC32.77■■■□□ 2.84
Myo5cE9Q1F5 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
Myo5cE9Q1F5 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC32.76■■■□□ 2.83
Myo5cE9Q1F5 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Myo5cE9Q1F5 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Myo5cE9Q1F5 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
Myo5cE9Q1F5 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
Myo5cE9Q1F5 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
Myo5cE9Q1F5 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Myo5cE9Q1F5 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
Myo5cE9Q1F5 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Myo5cE9Q1F5 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Myo5cE9Q1F5 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
Myo5cE9Q1F5 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
Myo5cE9Q1F5 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Myo5cE9Q1F5 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Myo5cE9Q1F5 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
Myo5cE9Q1F5 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Myo5cE9Q1F5 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms