Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ0

Ryr1, Ryanodine receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 5,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ryr1E9PZQ0 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ryr1E9PZQ0 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ryr1E9PZQ0 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ryr1E9PZQ0 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ryr1E9PZQ0 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ryr1E9PZQ0 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ryr1E9PZQ0 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ryr1E9PZQ0 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ryr1E9PZQ0 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ryr1E9PZQ0 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ryr1E9PZQ0 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ryr1E9PZQ0 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ryr1E9PZQ0 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ryr1E9PZQ0 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ryr1E9PZQ0 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ryr1E9PZQ0 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ryr1E9PZQ0 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ryr1E9PZQ0 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ryr1E9PZQ0 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ryr1E9PZQ0 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ryr1E9PZQ0 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ryr1E9PZQ0 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ryr1E9PZQ0 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ryr1E9PZQ0 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ryr1E9PZQ0 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ryr1E9PZQ0 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ryr1E9PZQ0 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ryr1E9PZQ0 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ryr1E9PZQ0 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ryr1E9PZQ0 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ryr1E9PZQ0 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ryr1E9PZQ0 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ryr1E9PZQ0 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ryr1E9PZQ0 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ryr1E9PZQ0 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ryr1E9PZQ0 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ryr1E9PZQ0 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ryr1E9PZQ0 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ryr1E9PZQ0 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ryr1E9PZQ0 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ryr1E9PZQ0 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ryr1E9PZQ0 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ryr1E9PZQ0 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ryr1E9PZQ0 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ryr1E9PZQ0 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ryr1E9PZQ0 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ryr1E9PZQ0 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ryr1E9PZQ0 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Ryr1E9PZQ0 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ryr1E9PZQ0 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ryr1E9PZQ0 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ryr1E9PZQ0 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ryr1E9PZQ0 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Ryr1E9PZQ0 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ryr1E9PZQ0 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ryr1E9PZQ0 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ryr1E9PZQ0 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ryr1E9PZQ0 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ryr1E9PZQ0 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ryr1E9PZQ0 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ryr1E9PZQ0 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ryr1E9PZQ0 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ryr1E9PZQ0 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ryr1E9PZQ0 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ryr1E9PZQ0 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ryr1E9PZQ0 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ryr1E9PZQ0 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ryr1E9PZQ0 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ryr1E9PZQ0 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ryr1E9PZQ0 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ryr1E9PZQ0 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ryr1E9PZQ0 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ryr1E9PZQ0 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ryr1E9PZQ0 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ryr1E9PZQ0 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ryr1E9PZQ0 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ryr1E9PZQ0 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ryr1E9PZQ0 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ryr1E9PZQ0 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ryr1E9PZQ0 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ryr1E9PZQ0 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ryr1E9PZQ0 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ryr1E9PZQ0 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ryr1E9PZQ0 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ryr1E9PZQ0 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ryr1E9PZQ0 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ryr1E9PZQ0 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ryr1E9PZQ0 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ryr1E9PZQ0 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ryr1E9PZQ0 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ryr1E9PZQ0 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ryr1E9PZQ0 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ryr1E9PZQ0 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ryr1E9PZQ0 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ryr1E9PZQ0 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ryr1E9PZQ0 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ryr1E9PZQ0 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ryr1E9PZQ0 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ryr1E9PZQ0 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ryr1E9PZQ0 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms