Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ54

Gcom1, GRINL1A complex locus, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcom1E9PZ54 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Gcom1E9PZ54 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gcom1E9PZ54 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gcom1E9PZ54 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gcom1E9PZ54 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gcom1E9PZ54 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gcom1E9PZ54 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gcom1E9PZ54 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gcom1E9PZ54 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gcom1E9PZ54 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gcom1E9PZ54 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gcom1E9PZ54 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gcom1E9PZ54 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gcom1E9PZ54 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gcom1E9PZ54 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gcom1E9PZ54 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gcom1E9PZ54 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gcom1E9PZ54 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gcom1E9PZ54 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gcom1E9PZ54 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gcom1E9PZ54 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gcom1E9PZ54 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gcom1E9PZ54 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gcom1E9PZ54 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gcom1E9PZ54 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gcom1E9PZ54 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gcom1E9PZ54 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gcom1E9PZ54 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gcom1E9PZ54 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gcom1E9PZ54 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gcom1E9PZ54 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gcom1E9PZ54 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gcom1E9PZ54 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gcom1E9PZ54 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gcom1E9PZ54 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gcom1E9PZ54 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gcom1E9PZ54 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gcom1E9PZ54 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gcom1E9PZ54 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gcom1E9PZ54 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gcom1E9PZ54 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gcom1E9PZ54 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gcom1E9PZ54 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gcom1E9PZ54 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gcom1E9PZ54 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gcom1E9PZ54 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gcom1E9PZ54 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gcom1E9PZ54 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gcom1E9PZ54 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gcom1E9PZ54 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gcom1E9PZ54 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gcom1E9PZ54 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gcom1E9PZ54 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gcom1E9PZ54 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gcom1E9PZ54 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gcom1E9PZ54 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gcom1E9PZ54 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gcom1E9PZ54 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gcom1E9PZ54 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Gcom1E9PZ54 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gcom1E9PZ54 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gcom1E9PZ54 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gcom1E9PZ54 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gcom1E9PZ54 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gcom1E9PZ54 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gcom1E9PZ54 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gcom1E9PZ54 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gcom1E9PZ54 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gcom1E9PZ54 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gcom1E9PZ54 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gcom1E9PZ54 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gcom1E9PZ54 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gcom1E9PZ54 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gcom1E9PZ54 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gcom1E9PZ54 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gcom1E9PZ54 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gcom1E9PZ54 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gcom1E9PZ54 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gcom1E9PZ54 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gcom1E9PZ54 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gcom1E9PZ54 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gcom1E9PZ54 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gcom1E9PZ54 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gcom1E9PZ54 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gcom1E9PZ54 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Gcom1E9PZ54 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gcom1E9PZ54 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Gcom1E9PZ54 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Gcom1E9PZ54 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gcom1E9PZ54 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gcom1E9PZ54 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gcom1E9PZ54 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gcom1E9PZ54 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gcom1E9PZ54 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gcom1E9PZ54 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gcom1E9PZ54 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gcom1E9PZ54 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gcom1E9PZ54 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gcom1E9PZ54 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gcom1E9PZ54 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 171.7 ms