Protein–RNA interactions for Protein: E9PYK3

Parp4, Poly [ADP-ribose] polymerase, mousemouse

Predictions only

Length 1,969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp4E9PYK3 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Parp4E9PYK3 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Parp4E9PYK3 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Parp4E9PYK3 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Parp4E9PYK3 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Parp4E9PYK3 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Parp4E9PYK3 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Parp4E9PYK3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Parp4E9PYK3 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Parp4E9PYK3 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Parp4E9PYK3 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Parp4E9PYK3 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Parp4E9PYK3 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Parp4E9PYK3 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Parp4E9PYK3 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Parp4E9PYK3 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Parp4E9PYK3 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Parp4E9PYK3 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Parp4E9PYK3 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Parp4E9PYK3 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Parp4E9PYK3 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Parp4E9PYK3 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Parp4E9PYK3 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Parp4E9PYK3 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Parp4E9PYK3 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Parp4E9PYK3 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Parp4E9PYK3 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Parp4E9PYK3 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Parp4E9PYK3 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Parp4E9PYK3 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Parp4E9PYK3 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Parp4E9PYK3 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Parp4E9PYK3 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Parp4E9PYK3 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Parp4E9PYK3 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Parp4E9PYK3 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Parp4E9PYK3 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Parp4E9PYK3 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Parp4E9PYK3 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Parp4E9PYK3 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Parp4E9PYK3 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Parp4E9PYK3 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Parp4E9PYK3 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Parp4E9PYK3 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Parp4E9PYK3 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Parp4E9PYK3 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Parp4E9PYK3 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Parp4E9PYK3 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Parp4E9PYK3 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Parp4E9PYK3 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Parp4E9PYK3 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Parp4E9PYK3 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Parp4E9PYK3 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Parp4E9PYK3 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Parp4E9PYK3 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Parp4E9PYK3 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Parp4E9PYK3 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Parp4E9PYK3 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Parp4E9PYK3 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Parp4E9PYK3 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Parp4E9PYK3 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Parp4E9PYK3 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Parp4E9PYK3 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Parp4E9PYK3 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Parp4E9PYK3 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Parp4E9PYK3 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Parp4E9PYK3 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Parp4E9PYK3 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Parp4E9PYK3 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Parp4E9PYK3 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Parp4E9PYK3 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Parp4E9PYK3 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Parp4E9PYK3 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Parp4E9PYK3 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Parp4E9PYK3 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Parp4E9PYK3 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Parp4E9PYK3 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Parp4E9PYK3 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Parp4E9PYK3 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Parp4E9PYK3 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Parp4E9PYK3 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Parp4E9PYK3 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Parp4E9PYK3 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Parp4E9PYK3 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Parp4E9PYK3 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Parp4E9PYK3 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Parp4E9PYK3 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Parp4E9PYK3 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Parp4E9PYK3 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Parp4E9PYK3 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Parp4E9PYK3 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Parp4E9PYK3 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Parp4E9PYK3 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Parp4E9PYK3 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Parp4E9PYK3 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Parp4E9PYK3 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Parp4E9PYK3 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Parp4E9PYK3 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Parp4E9PYK3 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Parp4E9PYK3 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms